内容来自互联网,如有侵权,请联系删除!导师们都很喜欢在论文里加上一条信号通路,进入实验室后不久,导师会给你课题的大方向,那么如何查找相关通路呢?除了阅读文献查询,KEGG数据库也是研究信号通路的一个很…
KEGGisadatabaseresourceforunderstandinghigh-levelfunctionsandutilitiesofthebiologicalsystem,suchasthecell,theorganismandtheecosystem,frommolecular-levelinformation,especiallylarge-scalemoleculardatasetsgeneratedbygenomesequencingand…
GO,KEGG,DO富集分析这是我听B站鲮鱼不会飞视频(GO,KEGG,DO富集分析)里的笔记哦~当然有的地方加上的是我自己的理解,如果哪里和视频上讲的不一样那是我自己发挥的,自行忽略....市面上公司做RNA-Seq的一般流程是:
本文原创发布于微信公众号“数据库百科”。未经许可,禁止转载。几乎现在的套路性文章在做完差异表达分析后,都会去做GO和KEGG富集分析。那么GO和KEGG都是什么?富集分析又是个什么东西呢?1为什么做富集分析?
收到的编辑意见如下pleaseforwardusanofficialKEGGdocumentwiththecopyrightpermissiontousefigs.4,5,6inmanuscriptentitled"ImpactofHydrogenontheTranscriptomeofSinorhizobiummeliloti1021UsingRNA-sequencingtechnology".我是否应该将图片许可转发到编辑室邮箱,还是其他方式,如果是发至该邮箱的画为什么被系统自动退回呢
KEGG注释很是常见,几乎涉及到功能注释的项目都会有KEGG注释及富集分析,那么当我们找到某些感兴趣的基因或通路后,我们能不能仅用我们感兴趣的基因绘制漂亮的KEGG代谢通路图呢?就像下面这样的!当然,是我们自己做,而不是求助公司!
GO、KEGG富集分析——DID与KOBAS在线分析工具在进行差异基因表达分析时,得到显著差异基因后,接下来就需要分析这些基因参与了哪些功能,常见的就是GO功能注释和KEGG通路富集分析,今天为大家介绍在线分析工具的使…
文章目录论文地址DID官网获得KEGG富集分析结果气泡图cytoscape软件绘制代谢通路网络图networkdatatabledata论文地址DID官网KEGG富集分析和GO富集分析方法一致,具体步骤见我上篇文章DID在线工具进行GO富集分析,这里主要展示可视化结果获得KEGG富集分析结果1.输入文件为所有差异表达基因列表2...
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