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论文通讯作者杨庆勇介绍，该研究通过整合4个已发表的方法，开发出高性能的大片段InDel鉴定工具IndelEnsembler，并将其应用于由1047个拟南芥品系构成的自然群体中，通过全基因组关联分析（GWAS）鉴定到与重要性状相关的、新的大片段InDel。
3）Indel在编码区间比碱基置换对基因功能的影响大得多，从而更易被自然选择所淘汰，使保守区间的突变率降低。换句话说，自然选择很大程度上是通过对Indel的选择而实现的，自发突变率的高低很大程度上是自然选择的结果。
在此基础上,鉴定了245个水稻品种124个InDel标记的基因型遗传多样性并进行了聚类分析,结果表明,水稻材料间存在明显的群体结构,基本反映了不同品种间的亲缘关系。.水稻功能性InDel标记的筛选与应用,不仅为品种纯度和真实性鉴定、遗传多样性分析提供了新方法...
论文查重开题分析单篇购买文献互助用户中心基于甘蓝型油菜基因组重测序开发InDel标记来自知网喜欢0阅读量：191作者：岳晓鹏展开摘要：近年来,随着高通量测序技术的发展,分子标记开发技术也得到了迅猛地发展.利用高通量技术...
NGS中IndelRealignment模块性能优化方法的设计与实现.张雷.【摘要】：高通量测序技术的发展推动了人类基因信息的相关研究,其中插入／缺失(Indel)的分析和检测是该研究的一项重要组成部分。.由于以Indel检测为基础的宏基因组学、全基因组关联分析及遗传疾病...
论文查重优惠论文查重开题分析单篇购买文献互助用户中心花生种质资源基于InDel标记的遗传多样性...3.24对InDel引物在54份资源品种间的PIC的变幅为0.0364(InDel-028)～0.9030(InDel-001),Shannon's(Ⅰ)变幅为0.0922(InDel-028)～2.447(InDel-001),其中...
ThevalidatedINDELmarkerswerealsotestedin12othersoybeancultivars.Thenumberofpolymorphismsinthepairwisecomparisonsof14soybeancultivarsvariedfrom27to165.TotesttheutilityoftheseINDELmarkers,theywereusedtoperformgeneticmappingofacrinklyleafmutant,andtheCRINKLYLEAFlocuswassuccessfullymappedtoa360kbregiononchromosome7.
该Indel-35中45bp片段编码的15个氨基酸残基含有一个丝裂原活化蛋白激酶(MPK)保守的磷酸化基序。研究发现，ZmMPK8作为低温的负调控因子与ZmRR1HapB互作并且磷酸化位于Indel-35中的Ser15，促进其通过26S蛋白酶体途径降解。...
image.png.通常利用二代测序数据检测单核苷酸多态性(SNP)和插入缺失（InDels）变异的基本流程是.1测序数据与参考基因组比对获得sam、bam格式数据.2samtools、GATK、freebayes等软件利用bam格式文件获得vcf格式文件.3snpeff对vcf格式文件进行注释.4vcf格式文件转换成...
使用INDEL和ORFS分别发现TFL1和FRIGIDA和拟南芥的抽薹时间显著关联（Songet.al.,2018,PlosGenetics,Figure3）该研究首次系统的报道了使用indel和基因功能进行GWAS分析的技术路线。宋宝兴认为这一技术在农作物的GWAS分析中将具有
论文通讯作者杨庆勇介绍，该研究通过整合4个已发表的方法，开发出高性能的大片段InDel鉴定工具IndelEnsembler，并将其应用于由1047个拟南芥品系构成的自然群体中，通过全基因组关联分析（GWAS）鉴定到与重要性状相关的、新的大片段InDel。
3）Indel在编码区间比碱基置换对基因功能的影响大得多，从而更易被自然选择所淘汰，使保守区间的突变率降低。换句话说，自然选择很大程度上是通过对Indel的选择而实现的，自发突变率的高低很大程度上是自然选择的结果。
在此基础上,鉴定了245个水稻品种124个InDel标记的基因型遗传多样性并进行了聚类分析,结果表明,水稻材料间存在明显的群体结构,基本反映了不同品种间的亲缘关系。.水稻功能性InDel标记的筛选与应用,不仅为品种纯度和真实性鉴定、遗传多样性分析提供了新方法...
论文查重开题分析单篇购买文献互助用户中心基于甘蓝型油菜基因组重测序开发InDel标记来自知网喜欢0阅读量：191作者：岳晓鹏展开摘要：近年来,随着高通量测序技术的发展,分子标记开发技术也得到了迅猛地发展.利用高通量技术...
NGS中IndelRealignment模块性能优化方法的设计与实现.张雷.【摘要】：高通量测序技术的发展推动了人类基因信息的相关研究,其中插入／缺失(Indel)的分析和检测是该研究的一项重要组成部分。.由于以Indel检测为基础的宏基因组学、全基因组关联分析及遗传疾病...
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ThevalidatedINDELmarkerswerealsotestedin12othersoybeancultivars.Thenumberofpolymorphismsinthepairwisecomparisonsof14soybeancultivarsvariedfrom27to165.TotesttheutilityoftheseINDELmarkers,theywereusedtoperformgeneticmappingofacrinklyleafmutant,andtheCRINKLYLEAFlocuswassuccessfullymappedtoa360kbregiononchromosome7.
该Indel-35中45bp片段编码的15个氨基酸残基含有一个丝裂原活化蛋白激酶(MPK)保守的磷酸化基序。研究发现，ZmMPK8作为低温的负调控因子与ZmRR1HapB互作并且磷酸化位于Indel-35中的Ser15，促进其通过26S蛋白酶体途径降解。...
image.png.通常利用二代测序数据检测单核苷酸多态性(SNP)和插入缺失（InDels）变异的基本流程是.1测序数据与参考基因组比对获得sam、bam格式数据.2samtools、GATK、freebayes等软件利用bam格式文件获得vcf格式文件.3snpeff对vcf格式文件进行注释.4vcf格式文件转换成...
使用INDEL和ORFS分别发现TFL1和FRIGIDA和拟南芥的抽薹时间显著关联（Songet.al.,2018,PlosGenetics,Figure3）该研究首次系统的报道了使用indel和基因功能进行GWAS分析的技术路线。宋宝兴认为这一技术在农作物的GWAS分析中将具有
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