找R语言做弦图的教程的时候发现了这个包:GOplot。其主要功能是可视化GO富集分析的结果。自己应该会用得到。第一步是学习其帮助文档中的例子,然后学习如何准备自己的数据,并利用这个包中的函数来绘图查看帮助…
R语言GOplot画弦图展示GO富集分析的结果之如何准备自己的数据这个是最终的结果,如果我自己拿到这个数据作图完全没有问题,但是这个推文写的内容可能是有些乱的,对于没有python基础的同学应该比较麻烦,争取花时间在研究研究,...
R语言利用GOplot实现功能分析可视化.生信中大家都不陌生GO分析,然而如何将分析结果进行可视化展示是我们苦恼的问题,大部分都是画个Bar图或者列个表格啥的。.今天我们给大家介绍一个可以实现功能分析可视化的R包GOplot。.在这里我们介绍下其中的z-score它...
论文中可能需要对使用到的R包进行引用,但是很多R包并没有相关的论文发表,这时就不知该怎么引用。在R中内置了一种方法,使用citation函数即可。比如想要引用ggplot2:citation(package=…
3.Origin使用时间最长的数据绘图软件,在普通工科院系Origin就是专业论文绘图标配。功能丰富全面,多图层在2D数据处理上非常实用(3D的没画过),简单画画容易上手,深入之后学习曲线开始变得平缓。由于渲染效果和自由度的限制,画出的图都...
R(编程语言)发表论文高分屏(高DPI)如何使用R语言输出高dpi图片?应投稿要求,需要不小于300dpi的图片,使用maps绘制了简单地图,直接保存dpi只有96。显示全部关注者10...
之前讲了这么多关于论文写作的技巧,又讲了这么多发表论文的tips,这次InVisor芳老师就响应大家的需求,给大家科普一波在撰写论文期间能用到的绘图工具,希望能解决大家在绘图制表方面的问题~首先,我们来看看绘图工具的重要性!作为文章内容的支撑,图表是最直接的整合数据的工具,能够...
原创:黄小仙上一次小仙同学分享了facetviolinplot的画法,最后还卖了个关子,给大家留了个悬念。科研文章的插图通常要求比较高,不仅要精准地展示出数据,选对图表类型,还需要简洁优美(翻译成人话就是,同…
R语言绘制的图形Mathematica/Matlab05这两款软件是不用多去介绍的,我想理工科的人再熟悉不过了,都是一个公司的。如果你说你没用过甚至没听过他们这“两兄弟”,我想你肯定不是个好的理工生,其功能的强大在于编程代码简单,默认出图漂亮...
下面进入正题,今天我们看看如何用富集分析的结果,进行GO可视化:.1.安装并加载包,关于包的安装,已经讲过多次,直接上代码:.2.GO富集分析,这次利用clusterProfiler包进行富集分析,当然你还需要安装该包并加载:.3.用内置数据集进行GO富集分析...
找R语言做弦图的教程的时候发现了这个包:GOplot。其主要功能是可视化GO富集分析的结果。自己应该会用得到。第一步是学习其帮助文档中的例子,然后学习如何准备自己的数据,并利用这个包中的函数来绘图查看帮助…
R语言GOplot画弦图展示GO富集分析的结果之如何准备自己的数据这个是最终的结果,如果我自己拿到这个数据作图完全没有问题,但是这个推文写的内容可能是有些乱的,对于没有python基础的同学应该比较麻烦,争取花时间在研究研究,...
R语言利用GOplot实现功能分析可视化.生信中大家都不陌生GO分析,然而如何将分析结果进行可视化展示是我们苦恼的问题,大部分都是画个Bar图或者列个表格啥的。.今天我们给大家介绍一个可以实现功能分析可视化的R包GOplot。.在这里我们介绍下其中的z-score它...
论文中可能需要对使用到的R包进行引用,但是很多R包并没有相关的论文发表,这时就不知该怎么引用。在R中内置了一种方法,使用citation函数即可。比如想要引用ggplot2:citation(package=…
3.Origin使用时间最长的数据绘图软件,在普通工科院系Origin就是专业论文绘图标配。功能丰富全面,多图层在2D数据处理上非常实用(3D的没画过),简单画画容易上手,深入之后学习曲线开始变得平缓。由于渲染效果和自由度的限制,画出的图都...
R(编程语言)发表论文高分屏(高DPI)如何使用R语言输出高dpi图片?应投稿要求,需要不小于300dpi的图片,使用maps绘制了简单地图,直接保存dpi只有96。显示全部关注者10...
之前讲了这么多关于论文写作的技巧,又讲了这么多发表论文的tips,这次InVisor芳老师就响应大家的需求,给大家科普一波在撰写论文期间能用到的绘图工具,希望能解决大家在绘图制表方面的问题~首先,我们来看看绘图工具的重要性!作为文章内容的支撑,图表是最直接的整合数据的工具,能够...
原创:黄小仙上一次小仙同学分享了facetviolinplot的画法,最后还卖了个关子,给大家留了个悬念。科研文章的插图通常要求比较高,不仅要精准地展示出数据,选对图表类型,还需要简洁优美(翻译成人话就是,同…
R语言绘制的图形Mathematica/Matlab05这两款软件是不用多去介绍的,我想理工科的人再熟悉不过了,都是一个公司的。如果你说你没用过甚至没听过他们这“两兄弟”,我想你肯定不是个好的理工生,其功能的强大在于编程代码简单,默认出图漂亮...
下面进入正题,今天我们看看如何用富集分析的结果,进行GO可视化:.1.安装并加载包,关于包的安装,已经讲过多次,直接上代码:.2.GO富集分析,这次利用clusterProfiler包进行富集分析,当然你还需要安装该包并加载:.3.用内置数据集进行GO富集分析...