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所以单篇的图形学论文很少见（再啰嗦一句，应用领域比较窄，所以教授们做研究也相对少）siggraph上实时图形学的研究成果几乎都是presentation，不是paper。几乎每年如此，GDC也是，顶级开发商会把最新的开发成果进行展示并且给出实现手法。
我们首先把gdc_download_20170405_074438.tar.gz这个压缩包解压，解压得到307个文件夹，也就是一本样本一个临床数据文件夹。7、把307个文件夹、MANIFEST.txt、get_clinical.pl脚本放在一起，我们在CMD里面输入代码"perlget_clinical.plMANIFEST.txt"，按回车，脚本文件开始运行，运行完就可以得到我们需要的clinical.txt
五月初了，大家的论文应该已经进入查重、二稿阶段了吧。说到查重，很多同学都会选择在提交论文前，先自己查重摸个底。虽然最保险的方式是自己用知网查，但是知网查一次太贵，所以大家会更倾向于用市面上免费的、或…
TCGA数据库除了有各种癌症的大样本数据外，还有很完善的临床数据，这点是其他数据库所缺少的，因此我们需要会从TCGA数据库中提取对应癌症的临床数据，然后利用这些数据来进行后续的分析（比如想知道某个基因的表达对病人的预后是否有
基因组图谱(TheCancerGenomeAtlas，TCGA)计划是由美国国家癌症研究院（NationalCancerInstitute，NCI）和美国国家人类基因组研究所（NationalHumanGenomeResearchInstitute，NHGRI）于2006年联合启动的项目，目前共计研究33种...
TCGAGDCDataPortal官网地址为：https://portal.gdc.cancer.gov/.进入GDC主页面之后，选择"Repository"进行查看以及下载数据(Browseanddownloaddata)；.GDChomepage.进来“Reoository”的界面如下图。.GDC给出了一系列的用户友好的选择框，你只需要根据条条框框来选择就可…
自己平时常用的是GEO，TCGA和GTEx数据库…（2）可以完成某基因在多的表达并且平行对比和做图；从基因层面或者类型层面入手检索（数据库来源TCGA和GTEx）下面盘点下几个主要的相关功能【1】单基因的表达检索以及生存分析输入...
TCGA数据相当有利用价值，然而其提供开放下载数据很少，都是大于level1的数据，除非其数据已发表相关文章，否则很难下载到。前一段时间，为了下载TCGA的原始数据花了不少时间，虽然可以下载，但下载速度很慢，至今找不到解决方法。但下载...
TCGA数据库使用常见问题答疑.1、问：TCGA数据库能做什么，是否需要收费？.答：TCGA数据库是美国国立癌症数据库，所以是专门用来分析癌症的数据库，不是做癌症的学员可以绕过，找找其他如GEO芯片数据库；TCGA数据库是开放提供给全球科研人员的，下载...
参考文献1.OshlackA,RobinsonMD,YoungMD(2010)FromRNA-seqreadstodifferentialexpressionresults.GenomeBiol11:220.2.AlexandrovLB,Nik-ZainalS,WedgeDC,AparicioSA,BehjatiS,etal.(2013)Signaturesofmutationalprocessesinhuman
所以单篇的图形学论文很少见（再啰嗦一句，应用领域比较窄，所以教授们做研究也相对少）siggraph上实时图形学的研究成果几乎都是presentation，不是paper。几乎每年如此，GDC也是，顶级开发商会把最新的开发成果进行展示并且给出实现手法。
我们首先把gdc_download_20170405_074438.tar.gz这个压缩包解压，解压得到307个文件夹，也就是一本样本一个临床数据文件夹。7、把307个文件夹、MANIFEST.txt、get_clinical.pl脚本放在一起，我们在CMD里面输入代码"perlget_clinical.plMANIFEST.txt"，按回车，脚本文件开始运行，运行完就可以得到我们需要的clinical.txt
五月初了，大家的论文应该已经进入查重、二稿阶段了吧。说到查重，很多同学都会选择在提交论文前，先自己查重摸个底。虽然最保险的方式是自己用知网查，但是知网查一次太贵，所以大家会更倾向于用市面上免费的、或…
TCGA数据库除了有各种癌症的大样本数据外，还有很完善的临床数据，这点是其他数据库所缺少的，因此我们需要会从TCGA数据库中提取对应癌症的临床数据，然后利用这些数据来进行后续的分析（比如想知道某个基因的表达对病人的预后是否有
基因组图谱(TheCancerGenomeAtlas，TCGA)计划是由美国国家癌症研究院（NationalCancerInstitute，NCI）和美国国家人类基因组研究所（NationalHumanGenomeResearchInstitute，NHGRI）于2006年联合启动的项目，目前共计研究33种...
TCGAGDCDataPortal官网地址为：https://portal.gdc.cancer.gov/.进入GDC主页面之后，选择"Repository"进行查看以及下载数据(Browseanddownloaddata)；.GDChomepage.进来“Reoository”的界面如下图。.GDC给出了一系列的用户友好的选择框，你只需要根据条条框框来选择就可…
自己平时常用的是GEO，TCGA和GTEx数据库…（2）可以完成某基因在多的表达并且平行对比和做图；从基因层面或者类型层面入手检索（数据库来源TCGA和GTEx）下面盘点下几个主要的相关功能【1】单基因的表达检索以及生存分析输入...
TCGA数据相当有利用价值，然而其提供开放下载数据很少，都是大于level1的数据，除非其数据已发表相关文章，否则很难下载到。前一段时间，为了下载TCGA的原始数据花了不少时间，虽然可以下载，但下载速度很慢，至今找不到解决方法。但下载...
TCGA数据库使用常见问题答疑.1、问：TCGA数据库能做什么，是否需要收费？.答：TCGA数据库是美国国立癌症数据库，所以是专门用来分析癌症的数据库，不是做癌症的学员可以绕过，找找其他如GEO芯片数据库；TCGA数据库是开放提供给全球科研人员的，下载...
参考文献1.OshlackA,RobinsonMD,YoungMD(2010)FromRNA-seqreadstodifferentialexpressionresults.GenomeBiol11:220.2.AlexandrovLB,Nik-ZainalS,WedgeDC,AparicioSA,BehjatiS,etal.(2013)Signaturesofmutationalprocessesinhuman
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