Falsediscoveryrate(FDR),一般翻译为错误发现率。在研究使用假设检验解决机器学习中的分类问题时,我遇到了多重假设检验问题。FWER和FDR正是解决这一问题的两种方法。经过老师和师兄师姐的指导,我能够将FDR应用于自己的问题当中,并且实验结果
多重检验中的FDR错误控制方法与p-value的校正及原文地址:多重检验中的FDR错误控制方法与p-value的校正及Bonferroni校正作者:流泪鱼数据分析中常碰见多重检验问题(multipletesting).Benjamini于1995年提出一种方法,通过控制FDR(FalseDiscoveryRate...
多重检验校正总结:(1)当同一个数据集有n次(n>=2)假设检验时,要做多重假设检验校正(2)对于Bonferroni校正,是将p-value的cutoff除以n做校正,这样差异基因筛选的p-valuecutoff就更小了,从而使得结果更加严谨(3)FDR校正是对每个p-value做校正
p值在一次检测中,我们很大概率上可以排除出错的情况,但是如果检测次数非常大的时候,我们就无法控制出错的情况(如果10000次检测,则可能有10000*5%=500次检测出错),这时候我们就需要多重假设检验来矫正错误,一种比较通用的方法就是FDR
在多重检验中提高判断标准的方法,我们就称之为多重检验校正。从1979年以来,统计学家提出了多种多重检验校正的方法。相应地,对p值校正之后的叫法也不一样,比如,FDR、Qvalue、Adjustedp-value,这个大家知道在多重检验时需要校正就行了,具体的用法作者有时间再教大家(这个作…
差异倍数(foldchange)foldchange翻译过来就是倍数变化,假设A基因表达值为1,B表达值为3,那么B的表达就是A的3倍。一般我们都用count、TPM或FPKM来衡量基因表达水平,所以基因表达值肯定是非负数,那么foldchange的取值就是(0,+∞).
9多重假设检验方法及其在经济计量中的应用.复杂数据主要表现在维数高、相依、非线性与不完全观测等,在基因序列、股市和社会经济等领域中经常出现。.传统的数理统计学方法在处理低维、、线性与完全数据时有效,但面对如此复杂的数据时,困难...
对于多重假设检验得到的P值需要进行校正。因为P值的阈值是人为规定的,无论是多小的P值,也仅仅能代表结果的低假阳性,而非保证结果为真。即使P值已经很小(比如0.05),也会被检验的总次数无限放大。比如检验10000次,得到假阳性结果的...
这是使用多重检验校正控制错误率后的结果。举个例子,当我们使用p<0.05为基准时,那么每20个基因,就可能有一个单纯因为概率被认为p<0.05,而当我们对上万个基因分析表达差异时,必须排除这种因为概率导致的假阳性,因此需要使用Bonferroni校正等方法控制falsediscoveryrate(FDR),并得…
怎么在Pearson’scorrelation得到falsediscoveryrate(FDR)值.利用R里面的cor.test(x,y),结果中会输出cor(也就是相关系数)和p-value,对于两个变量的p-value而言不用算fdr的,或者说,此时的p-value就是你拒绝原假设的fdr。.但在做了多个变量后得到了多个p-value后,可用p...
Falsediscoveryrate(FDR),一般翻译为错误发现率。在研究使用假设检验解决机器学习中的分类问题时,我遇到了多重假设检验问题。FWER和FDR正是解决这一问题的两种方法。经过老师和师兄师姐的指导,我能够将FDR应用于自己的问题当中,并且实验结果
多重检验中的FDR错误控制方法与p-value的校正及原文地址:多重检验中的FDR错误控制方法与p-value的校正及Bonferroni校正作者:流泪鱼数据分析中常碰见多重检验问题(multipletesting).Benjamini于1995年提出一种方法,通过控制FDR(FalseDiscoveryRate...
多重检验校正总结:(1)当同一个数据集有n次(n>=2)假设检验时,要做多重假设检验校正(2)对于Bonferroni校正,是将p-value的cutoff除以n做校正,这样差异基因筛选的p-valuecutoff就更小了,从而使得结果更加严谨(3)FDR校正是对每个p-value做校正
p值在一次检测中,我们很大概率上可以排除出错的情况,但是如果检测次数非常大的时候,我们就无法控制出错的情况(如果10000次检测,则可能有10000*5%=500次检测出错),这时候我们就需要多重假设检验来矫正错误,一种比较通用的方法就是FDR
在多重检验中提高判断标准的方法,我们就称之为多重检验校正。从1979年以来,统计学家提出了多种多重检验校正的方法。相应地,对p值校正之后的叫法也不一样,比如,FDR、Qvalue、Adjustedp-value,这个大家知道在多重检验时需要校正就行了,具体的用法作者有时间再教大家(这个作…
差异倍数(foldchange)foldchange翻译过来就是倍数变化,假设A基因表达值为1,B表达值为3,那么B的表达就是A的3倍。一般我们都用count、TPM或FPKM来衡量基因表达水平,所以基因表达值肯定是非负数,那么foldchange的取值就是(0,+∞).
9多重假设检验方法及其在经济计量中的应用.复杂数据主要表现在维数高、相依、非线性与不完全观测等,在基因序列、股市和社会经济等领域中经常出现。.传统的数理统计学方法在处理低维、、线性与完全数据时有效,但面对如此复杂的数据时,困难...
对于多重假设检验得到的P值需要进行校正。因为P值的阈值是人为规定的,无论是多小的P值,也仅仅能代表结果的低假阳性,而非保证结果为真。即使P值已经很小(比如0.05),也会被检验的总次数无限放大。比如检验10000次,得到假阳性结果的...
这是使用多重检验校正控制错误率后的结果。举个例子,当我们使用p<0.05为基准时,那么每20个基因,就可能有一个单纯因为概率被认为p<0.05,而当我们对上万个基因分析表达差异时,必须排除这种因为概率导致的假阳性,因此需要使用Bonferroni校正等方法控制falsediscoveryrate(FDR),并得…
怎么在Pearson’scorrelation得到falsediscoveryrate(FDR)值.利用R里面的cor.test(x,y),结果中会输出cor(也就是相关系数)和p-value,对于两个变量的p-value而言不用算fdr的,或者说,此时的p-value就是你拒绝原假设的fdr。.但在做了多个变量后得到了多个p-value后,可用p...