本文就介绍转录组数据分析的第一步分析:质控,主要就是fastqc这个软件的使用和结果解读。.一.fastqc介绍.拿到原始数据后我们首先采用fastqc程序进行质控,看原始数据质量情况,fastqc会生成一个html结果报告,根据图形化界面,我们可以判断下机数据情况是否...
数据的质量控制——fastQC,编者按目前的高通量测序技术可以在单次运行中产生数亿个序列。在分析此序列以得出生物学结论之前,应该执行一些简单的质量控制检查,以获得较好的原始数据,并且确保数据中没有任何问题或偏差,本文就来介绍一款简单常用的质量检测工具fastQC。
二代测序质量控制(FastQC)【图文】,【最近拿到了近1TB的全基因组测试数据,在数据分析之前,有必要对数据质量进行评价】在二代测序过程中,测序仪通过荧光成像读出每一个DNA或者RNA序列的碱基类型。在大量的阅读识别碱基过程中,难免...
fastqc除了列出所有over-representedk-mers,还会把前6个的perbasedistribution画出来。当有出现频率总体上3倍于期望或是在某位置上5倍于期望的k-mer时,报”WARN“;当有出现频率在某位置上10倍于期望的k-mer时报"FAIL"。
《BIOLOGICALCONTROL》评估说明《BIOLCONTROL》发布于爱科学网,并永久归类相关SCI期刊导航类别中,本站只是硬性分析"《BIOLCONTROL》"的杂志可信度。杂志真正的价值在于它是否为社会的发展带来积极促进作用。
2019-10-21论文中自动生成参考文献再重复使用前面的序号该怎么设置42011-12-12自动生成的参考文献在文章最后,怎么调到中间442017-06-27论文查重需要把参考文献放进去吗1292017-12-25写论文,引用老师课件ppt上的内容
在该文件中,会给出杂合度,基因组大小。重复片段长度等详细信息。2.plot.png示意图如下:蓝色区域是实际观测到的kmer分布,红色线条下方是一些频数很低的kmer,这些kmer被认为是测序错误,黑色线条下方被认为是可靠的kmer数据,只拿这部分数据来评估基因组的大小,垂直的虚线认为…
FastQC分??析结果显示,接头去除较为彻底,而且由于切除了?reads前后的低质量碱基,??整体的测序质量有所提高。图2所示为ATAC_Kl_Rl.fq的质控结果,包括其??在内,6组ATAC-seq在去除接头后全部通过质控。
本文就介绍转录组数据分析的第一步分析:质控,主要就是fastqc这个软件的使用和结果解读。.一.fastqc介绍.拿到原始数据后我们首先采用fastqc程序进行质控,看原始数据质量情况,fastqc会生成一个html结果报告,根据图形化界面,我们可以判断下机数据情况是否...
数据的质量控制——fastQC,编者按目前的高通量测序技术可以在单次运行中产生数亿个序列。在分析此序列以得出生物学结论之前,应该执行一些简单的质量控制检查,以获得较好的原始数据,并且确保数据中没有任何问题或偏差,本文就来介绍一款简单常用的质量检测工具fastQC。
二代测序质量控制(FastQC)【图文】,【最近拿到了近1TB的全基因组测试数据,在数据分析之前,有必要对数据质量进行评价】在二代测序过程中,测序仪通过荧光成像读出每一个DNA或者RNA序列的碱基类型。在大量的阅读识别碱基过程中,难免...
fastqc除了列出所有over-representedk-mers,还会把前6个的perbasedistribution画出来。当有出现频率总体上3倍于期望或是在某位置上5倍于期望的k-mer时,报”WARN“;当有出现频率在某位置上10倍于期望的k-mer时报"FAIL"。
《BIOLOGICALCONTROL》评估说明《BIOLCONTROL》发布于爱科学网,并永久归类相关SCI期刊导航类别中,本站只是硬性分析"《BIOLCONTROL》"的杂志可信度。杂志真正的价值在于它是否为社会的发展带来积极促进作用。
2019-10-21论文中自动生成参考文献再重复使用前面的序号该怎么设置42011-12-12自动生成的参考文献在文章最后,怎么调到中间442017-06-27论文查重需要把参考文献放进去吗1292017-12-25写论文,引用老师课件ppt上的内容
在该文件中,会给出杂合度,基因组大小。重复片段长度等详细信息。2.plot.png示意图如下:蓝色区域是实际观测到的kmer分布,红色线条下方是一些频数很低的kmer,这些kmer被认为是测序错误,黑色线条下方被认为是可靠的kmer数据,只拿这部分数据来评估基因组的大小,垂直的虚线认为…
FastQC分??析结果显示,接头去除较为彻底,而且由于切除了?reads前后的低质量碱基,??整体的测序质量有所提高。图2所示为ATAC_Kl_Rl.fq的质控结果,包括其??在内,6组ATAC-seq在去除接头后全部通过质控。