中国和平利用军工技术协会的前身是全国军工技术转民用联络组,1987年对外称谓是“中国人民和平利用军工技术促进会”。1987年10月7日,国务院科技领导小组办公室批复全国军工技术转民用工作联络组成立“中国人民和平利用军工技术促进会”。1989年4月8日,“中国人民和平利用军工技术促进会”更名为”中国和平利用军工技术协会”。1989年12月5日,协会组织架构进行了调整。1991年8月1日,协会经民政部重新核准登记,正式成为民间社团组织,由原国防科工委主管。1991年4月13日,第一届全国会员代表大会召开。2000年,划归“国防科学技术工业委员会”主管。2000年3月7日,协会《中国军转民》杂志社成立,并予以注册登记。2000年12月18日,第二届全国会员代表大会召开。2002年4月17日,民政部批准协会建立“中国和平利用军工技术基金管理委员会”分支机构。2003年9月8日,民政部批准协会建立“中国和平利用军工技术协会研究与咨询专业委员会”分支机构。2004年12月9日,获得民政部颁发的“全国先进民间组织”称号。2005年11月29日,第三届全国会员代表大会召开。2007年7月27日,原国防科工委批准协会成立“非公有制经济参与国防科技工业建设咨询服务中心”。2011年12月9日,中国和平利用军工技术协会第四届全国会员代表大会在北京召开。