会议论文一般是有主题的，比如某个行业举行一个行业性的学术会议，同时会把会议期间用于交流的论文在学术期刊上出版。这类型的论文称之为会议论文。
我觉得这个答案优质，复制一下：
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两者区别很大，容易被非学术人士误解。很多回答不够简明，通俗地说：
a. 期刊论文（Journal paper）：需要同行评审（peer review），通过率低，重要性较高。
b. 会议论文（Conference paper）：不需要评审，通过率高，重要性较低。
一般来说：
一些学术会议都会征稿（call for paper）；与会人员往往都要提交论文参加会议交流的，这种论文会装订成论文集有的也会集结出版。这个会议论文一般要比期刊的档次低一些，发表容易些。不过很多单位并不算科研成果。但也有一些较顶级的会议论文，如EI检索（这种也有低档次的，甚至有检索不了的）要求同行审稿的，水平不低。就看是什么会议了
论文集就是受认可的。
会议论文集论文算正式发表吗？论文集有两种类型，一种是期刊出版的论文集，另一种就是会议论文集了，会议论文集的适用范围以及认可度通常是高于期刊论文集的，毕竟高水平的学术会议学术价值也是非常高的，相比较而言，期刊论文集则没有这么高的认可度以及适用范围，期刊论文集在大多数情况下不受认可，而会议论文集只要学术会议是正规会议，
所以文章发表在正规学术会议出版的论文集，这当然算是论文正式发表，会议论文的发表无论是在国内还是在国外，都是备受认可的，特别是国际上一些影响力比较大的权威学术会议，这种会议以及这种会议宣读并发表的论文学术价值都是非常高的，可以算是顶尖学术论文的发表了，因此这类会议论文集作者是可以放心发表的
相较之下，水平相对一般的会议论文集其学术价值也较为有限，在特定领域中发挥的作用也比较有限
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