可以的。这个问题要看您的论文中是否涉及到该企业的核心数据和未公开信息，以及是否对该企业形象造成负面影响。在知网数据库上我们可以很容易看到对大公司如联想、华为等公司的分析和解读，这些分析的数据大多来源于公开信息，而且也没有对该公司过于负面的分析，不构成侵权。但如果使用的数据是未公开信息，或者论文中涉及关乎公司形象、声誉和股价的敏感话题就很有可能不太合适了。虽然不一定构成侵权，但是论文一定会被PASS掉，所以如果涉及敏感问题一般还是不要直接出现公司真名为好，欢迎您采纳。
分公司只需在总公司的名称之后加上分公司名称即可，一般可以描述为：1、总公司名称+地域+分公司(例如：深圳xx科技有限公司徐汇分公司)2、总公司名称+第一分公司等(例如：深圳xx科技有限公司第一分公司)
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仗剑拂衣去
