2003年至2010年，该校申请到带经费的国家级、部委级科研项目14项，获准立项的省级各类项目301项，校外拨入经费1027.7万元。2006年至2011年，该校共获国家自然基金项目12项，国家社科基金项目4项，教育部人文社科研究项目11项。2007年至2010年四年期间，申报专利34项；获授权专利18项；教师发表论文2108篇，比前四年增加了440多篇；论文被SCI、EI、ISTP收录288篇 。2009年至2013年，该校共承担国家基金项目29项，部委级科研项目28项，省级各类科研项目268项；申请专利67项，授权专利60项。校外拨入科研经费3092.73万元；被SCI、EI、ISTP等国际权威检索工具收录的论文达560篇。学校每年拿出专项资金用于奖励科研成果突出的优秀人员，五年中，各类科研奖励金额累计达1200多万元 。2014年，该校获得山西省国家资源型经济转型综合配套改革试验重大课题立项，资助金额为人民币80万元，为该校在该领域获得的第一个科研项目 。 山西省重点研究基地：山西大同大学云冈文化研究中心（下设北魏历史文化研究所和辽金文学研究所）校级研究所：固体物理研究所、有机化学研究所、脑科学研究所、免疫学研究所、煤炭采矿工程研究所、社会科学发展研究所、应用化学研究所、理论物理研究所、呼吸病与职业病研究所、炭材料研究所、高寒作物研究所院级研究所：应用数学研究所、技术创新管理研究所、煤矿机电技术研究所、地方经济研究所、教育科学研究所 （以上名单为2014年6月学校官网所载名单） 2006年6月，与中国辽金文学学会联合主办“中国辽金文学国际高级论坛”。2008年5月，举办“北朝都城与历史文化国际学术研讨会”。2009年10月，举办“首届云冈文化论坛”。2010年9月，承办全国“马克思主义与文化遗产”学术研讨会暨全国马列文论研究会第27届年会。2011年8月，承办了中国引力与相对论天体物理学会2011年年会暨2011全国引力理论与宇宙学研讨会 。
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