和学校评定准则有关，不同学校有不同的要求。至于你的顾虑，我还没有听说有学校这么做。以我的学校来说，学校任第一、二作者为同一个积分，这是因为通常学生为第一作者，第二作者必然写自己的导师，比如一篇CSCD核心为150分，CSCD扩展为80分，普通的双核为20分，等等。我不明白你的论文第二作者为什么不写自己导师呢？
不用论文数据，自己重新开始做所有实验，重新整理 可以挂新单位为第一单位，但这时候最好挂原单位为2单位，毕竟idea是那时候出来的。如果使用数据，那么无疑问，得挂原单位为第一∞
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可爱的giraffe
