不会影响。论文要公开了才是现有技术，没公开当然不会影响你导师专利的新颖性了。
不能在申请挂基金项目了，因为已经被收录了，只是杂志社还没有到发表的时间，正常的话从收到录用通知到拿到样刊是3个月左右的，如果你是核心的话时间就更久了，录用通知上面会显示时间，申请基金项目也是需要一个时间的，如果你提交了文章，两面都过了，是会被判定为重复投稿的，这个是要担负法律责任的，属于一稿多投，希望可以帮助到你
在参考文献末尾标注：(to be published)
得看基金项目的要求了。有的用录用函可以，有的必须用期刊原件。
已经录用的文章，信息是不能再做修改的，申请了也加不上，反而编辑会觉得你很麻烦！
联系编辑，如果还未定稿印刷，就可以添加的
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