只要偏离不大就行。只要有相应研究基础就可以了，不一定完全一致。申请的东西，未必要跟博士论文相关。但如果是博士论文延续的话，肯定申请水平很高啊。毕竟在这个方向上耕耘了好多年了。国家杰出青年科学基金是中国为促进优秀学术带头人而特别设立的科学基金。
不会被课题主办方认可。课题结题论文与课题一致才能体现课题研究的过程，两者一致是评审标准之一。虽然两者也不一定非得一致，但与课题一致的论文，才有机会成为课题结课论文，所以一致很重要。
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