一、收录情况不同
维普收录最久，万方收录时间最短，但是现刊万方收录最好，维普很多期刊都没有了，特别是医学类的。
二、检索结果
中国知网的结果最多，维普第二，万方最少。
三、归类方式不同
中国知网能按照年份、来源数据库、文献出版来源、作者、研究层次、基金资助、中文关键词、作者单位等对所获得的文献进行归类分析，维普能按照全部期刊、核心期刊、CSSCI期刊、近五年期刊文献、近三年期刊文献和近一年期刊文献对所获得的文献进行归类分析，万方能按照论文类型、年份、期刊和学术类别对所获得的文献进行归类分析。
四、覆盖范围
万方：自然科学、数理化、天文、地球、生物、医药、卫生、工业技术、航空、环境、社会科学、人文地理等各学科领域。
维普：自然科学专辑、农业科学专辑、医药卫生专辑、教育科学专辑、经济管理专辑、图书情报专辑、工程技术专辑。
知网：自然科学、人文社会科学及工程技术各领域知识，拥有期刊、报纸、博硕士培养单位的博士和优秀硕士学位论文、全国重要会议论文。
医学杂志期刊有：
1、《中国社区医师》：国内发行量最大的国家级综合性医学期刊、中国知网收录期刊、旬刊。
2、《医学信息》：国内发行速度最快的国家级综合性医学期刊、中国知网收录期刊、旬刊。
3、《吉林医学》：创刊历史久远，综合性医学学术期刊、旬刊、中国知网收录期刊。
4、《中国医药指南》：国家级科技期刊、半月刊、中国知网收录期刊。
5、《中国中医药现代远程教育》：国家级科技期刊、半月刊、中国知网收录期刊。
6、《内蒙古中医药》：综合性学术期刊、旬刊、万方收据库收录期刊，职称晋升认定期刊。
7、《按摩与康复医学》：国家级优秀科技期刊、中华中医药学会系列、万方数据库收录、职称晋升认定期刊。
8、《中国卫生产业》：国家级医药卫生期刊、月刊、中国核心期刊(遴选)数据库收录期刊。
9、《中国当代医药》：国家级医药卫生专业刊物、旬刊、中国知网收录期刊。
10、《中国美容医学》：中国科技核心期刊、月刊、中国知网收录期刊。
11、《中国药业》：中国科技核心期刊、半月刊、中国知网收录期刊。
12、《临床合理用药杂志》：综合性医药卫生类学术期刊、半月刊、中国知网收录期刊。
万方数据库、维普资讯网、中国知网的区别
简单比较：
1、从收录情况来看，维普收录最久，万方收录时间最短，但是现刊万方收录最好，维普最近两年的很多期刊都没有了，特别是医学类的。
2、文档的清晰度：万方最高，维普最差。
3、使用方便性：知网和万方差不多，维普最差。
4、其它：万方的期刊浏览功能做的很好。
更加深入比较：
中国知识资源总库（CNKI）《中国知识资源总库》是由清华大学主办、中国学术期刊（光盘版）电子杂志社出版、清华同方知网（北京）技术有限公司发行、数百位科学家、院士、学者参与建设，精心打造的大型知识服务平台和数字化学习系统。目前，《总库》囊括了自然科学、人文社会科学及工程技术各领域知识，拥有期刊、报纸、博硕士培养单位的博士和优秀硕士学位论文、全国重要会议论文、中小学多媒体教辅以及1000多个加盟数据库。全文采用CAJ和PDF格式，必须下载专门的CAJ和PDF浏览器才可阅读。
中国知识资源总库的重点数据库有：
《中国期刊全文数据库（CJFD）》截至2007年3月共收录了国内8127种期刊，全文文献总量已达2272万多篇，收录起始时间一般为1994年，个别追溯到1979年或创刊年，按学科分126个专题，内容每日累增。产品形式有网络形式、光盘形式、《中国期刊专题全文数据库光盘版》。
《中国优秀博硕士学位论文全文数据库（CDMD）》收录2000年至今300多个博硕士培养单位的学位论文，内容每日累增。
《中国重要报纸全文数据库（CCND）》收录2000年至今1000多种重要报纸，内容每日累增。
《中国重要会议论文集全文数据库》（CPCD）收录2000年至今400家学术团体的会议论文，内容每日累增。
《中国企业知识仓库（CEKD）》收录国内5400余种核心与专业特色期刊、博硕论文、报纸、行业标准、法律法规、行业经济数据统计、行业深度研究报告、技术发展动态、国外经济发展动态等信息，涵盖企业技术创新、经营决策、企业管理、WTO、行业动态等专业资料信息。
《中国图书全文数据库》《中国年鉴数据库》《各行业百科数据库》《声像资料数据库 》《《保持共产党员先进性教育》专题数据库》等。
以中国期刊全文数据库为例讲解CNKI的检索方式。中国期刊全文数据库有分类检索、初级检索、高级检索和专业检索四种方式。在每种方式的检索结果（包括二次检索的检索结果）里都可以进行二次检索，可以无数次的进行，逐步缩小检索范围，直至检索结果为零。
重庆维普资讯有限公司是科学技术部西南信息中心下属的一家大型的专业化数据公司,是中文期刊数据库建设事业的奠基人。自1989年以来,一直致力于期刊等信息资源的深层次开发和推广应用,集数据采集、数据加工、光盘制作发行和网上信息服务于一体；收录有中文期刊8000种,中文报纸1000种,外文期刊4000种,拥有固定客户2000余家。目前已成为推动我国数字图书馆建设的坚强支柱之一。
在以上的数据库中，最为常用也最受大家欢迎的是《中文科技期刊数据库》。它源于重庆维普资讯有限公司1989年创建的《中文科技期刊篇名数据库》，其全文和题录文摘版一一对应，经过16年的推广使用和完善，全面解决了文摘版收录量巨大但索取原文繁琐的问题。全文版的推出受到国内广泛赞誉，同时成为国内各省市高校文献保障系统的重要组成部分。《中文科技期刊数据库》还是目前世界最大的连续动态更新的中文期刊全文数据库，积累全文文献728多万篇，分七大专辑:自然科学专辑、农业科学专辑、医药卫生专辑、教育科学专辑、经济管理专辑、图书情报专辑、工程技术专辑 。
万方数据库简介
知识来源：万方数据股份有限公司是国内第一家以信息服务为核心的股份制高新技术企业，作为国内第一批开展互联网服务的企业之一，万方数据坚持以信息资源建设为核心，努力发展成为中国第一的信息服务提供商，开发独具特色的信息处理方案和信息增值产品，为用户提供从数据、信息到知识的全面解决方案，服务于国民经济信息化建设，推动中国全民信息素质的成长。
覆盖范围：自然科学、数理化、天文、地球、生物、医药、卫生、工业技术、航空、环境、社会科学、人文地理等各学科领域。
收录年限：《中国会议论文全文数据库》主要收录1998年以来国家级学会、协会、研究会组织召开的全国性学术会议论文。
中国知网，万方，维普区别在于数据库、收录年限、数据处理效率的不同。具体如下：
1、数据库内容不同：
知网从1994年起，收录了6000多种期刊，其中有5400多种是全文期刊，约664万篇全文。以收录核心期刊和专业期刊为主，共9大系列126个专题。
维普1989年至1999年收录期刊达7000余种，2000年以来达到12000余种，几乎涵盖全部国内中文出版物。内容以自然科学和工程技术为主。
万方1998年以来共收录期刊2700余种，约30余万篇全文。学科分为基础科学、人文科学、医药卫生、工业技术。核心期刊比例高。内容以科技信息为主，兼顾人文，适合工科或理工科院校。
2、收录年限不同：
知网：主要为1994年至今，但有3500余种期刊回溯至创刊年。
维普：收录期刊的年限为1989年至今。
万方：收录期刊的年限1998年。
3、数据处理效率不同：
知网：论文类“每日更新”，其他大多数资料每月更新，针对全库更新。
万方：不定期更新，更新量不定。
维普：半月更新。
