1、创新性差。创新性是医学科研论文的核心，实验论点重复别人已发表的文献，或经过简单推理就能从已知的文献中推理获得，或重复他人工作的稿件常被拒稿。对于医学期刊来讲，只有把创新性好、具有报道价值的论文发表出来，才能保证同定的读者群和更好地推进医学科技的发展。
2、科研设计不合理。一是根本就没有设计，作者在写作前仓促上阵，临时应付，没有认真考虑文章整体布局，以至文章存在无法弥补的缺陷。二是设计的内容有缺陷，例如分组没有真正的“随机化”，没有研究对象的选择、诊断、纳入和排除标准，观察对象的可信度差，说明优越性没有对照组，组间没有进行均衡性检验。
3、不符合投稿期刊的报道范围。医学的各个领域，基本都有相对比较专业对口的期刊，因此，在投稿时，应对所投期刊进行研究，选择报道范围与自己稿件内容相近的期刊投稿。
其实最主要的原因还是你写的稿件不太好，或者是与杂志社要求的内容不太符合，建议你投稿之前先看一下杂志社以前的文章，看一下他们是什么风格，然后你可以按照那个风格写，这样被选中的概率比较大。
出现退改的情况无疑就两个原因：其一：格式不符合发刊标准，修改后可再次投稿；其二：学术课题在实验性、理论性上没有新的科学研究成果或是没有提供新的科技信息，而是重复、模仿、抄袭前人的工作，此类情况就比较麻烦，得要推倒重来，重新写作后再投。
遇到退改，作者不要沮丧，这非常正常，按照退改意见认真修改后，被录用的可能性就增大了。一般来说，如果收到的是退改决定，你应该感到庆贺，因为这提示你，你的稿件具有被录用发表的可能。
但是，需要提醒的是，你如收到了退改信，并不一定就表示你的稿件就一定不会被录用，其前提是你必须按照退改要求上的修改建议来全部地认真地修改。你的稿件按照修改意见更新修改稿件后，也不一定就表示一定会被录用的。不过，如果你完全遵照退改意见去修改你的稿件了，一般被录用的可能性是非常大的。
退改的稿子应及时修改后反馈回编辑部，这样会加快你稿件的处理进度。如果收到的退改意见很棘手，这时你得考虑更新进行大修改，这就费时间、精力和财力了；对于棘手的退改意见，如果你无法办到，那就要考虑改投他刊了。因为，有时有的审稿人会给你出一两个既刁难而又是客观的问题让你无法问答修改。如果在退改意见中，存在错误或者不合理的评审意见，一定要认真澄清和解释。你认真澄清和解释后，编辑和审稿人还是不能认可理解的话，那你要么改投他刊，不必再浪费时间了，要么继续申辩，但要注意在继续申辩的过程中绝对不能存在敌意，要心平气和。
终审被拒稿很常见的一个原因可能是修改过程中不到位，没有达到杂志社的要求，也可能是自己杂志上发表过类似文章，近期不打算在刊登同样类型的文章。但具体原因的话，还是和杂志编辑部联系沟通一下去了解吧。
此外，在终审阶段，杂志社会根据论文的质量和创新度进行衡量，如果完整达不到要求的创新度，刷下来也是情理之中的。当然，有些论文可能立意好，质量也高，但是最后杂志主编在审核的时候，认为可信度并不高，又对结果有不同的看法，可能也会被退稿。
退稿是指编辑部把不采用的稿子退还作者，出自鲁迅《书信集·致孙用》：“我选稿并编辑‘北新’，退稿并酌送稿费。”
