本科毕业论文最后都由学校院系保存或者保存在学生就业指导与服务中心学生档案室。
1、由学校院系保存。
以上海交通大学为例，毕业论文最后由学校院系保存。按照《上海交通大学关于本科生毕业设计（论文）工作的若干规定》的相关规定，学生在答辩与评分以后，毕业论文都需要采用资料保存归档。
2、保存在学生就业指导与服务中心学生档案室。
以武汉大学为例，为适应国家人事工作需要，在校期间学生档案应及时收集、整理，不断充实完善。毕业时学生档案应包含以下材料：高校毕业生（毕业研究生）登记表、毕业生（毕业研究生）就业通知书等材料。各学习阶段实习鉴定表、实习报告等材料。
学生毕业、结业、肄业、转学、退学、出国或死亡等学籍变动发生后，学生学籍管理部门应及时通知学生就业指导与服务中心学生档案室办理档案转递手续。
毕业论文要求规定：
1、毕业论文在进行编写的过程中，需要经过开题报告、论文编写、论文上交评定、论文答辩以及论文评分五个过程，其中开题报告是论文进行的最重要的一个过程，也是论文能否进行的一个重要指标。2、毕业论文为应考者的总结性独立作业，目的在于总结学习专业的成果，培养综合运用所学知识解决实际问题的能力。3、考生要对所搜集到手的资料进行全面浏览，并对不同资料采用不同的阅读方法，如阅读、选读、研读。
毕业论文上传数据库：
并不是所有的毕业论文，知网数据库都会收录的。像本科毕业论文的话，一般会抽取评定为优秀毕业论文的入库。硕士以及研究生论文大部分都会收录，但主要还是看学校，有些学校收录的情况不同，不能一概而论。
如果抄袭往届学长学姐没有被知网收录的论文，会被检测出吗？
所有的毕业论文，学校会收录整理的，也就是学校本地的自建库。所以不要妄想抄袭往届学长学姐的论文，以为知网检测系统会查不到，就抱着侥幸心理通过的想法，像这些有案可查的，一定不要偷懒去投机取巧。
有些同学的文章被期刊发表后，这些文章是否被知网收录？又什么时候才能入知网数据库呢？期刊里的文章是都要上传知网数据库的，一般由编辑部把电子版送到知网数据库，然后再经过一段时间生成特定电子版本的文件后，才能在知网上检索到。这个时间一般是三个月左右，每个期刊的上传的时间不同和数据库不同，所以没有准确的日期。
论文发表的过程是比较复杂的，每个环节都是需要注意的，可能哪个环节没有注意到就会影响到论文不能顺利的发表。论文发表审核就占据绝大部分的时间，所以提前根据论文要求撰写好论文，这样就可以节省一些时间。
归学校。
毕业设计工作结束后，所有的毕业设计、论文资料（包括图纸、实验记录、原始数据、实物照片、图片、录音、设计手稿等）学生不能自行带走，有学院负责回收作为教学资料妥善保存，整理归档；
若需公开发表，须经指导老师同意。
毕业论文基本上都是交给自己的指导老师，这个话很正确的。
图书馆。根据《毕业论文提交图书馆流程》显示，通常情况下，如若发现优秀的毕业论文，导师就会提交给图书馆，再由图书馆提交到知网，知网会根据论文的质量、稀缺度等筛选后收录，并不一定全部收录。论文常用来指进行各个学术领域的研究和描述学术研究成果的文章，简称之为论文。
