1、论文内容主要包括：封面、声明、中英文摘要、目录、主要符号对照表、正文、致谢、参考文献、附录、原创性声明或者授权声明以及学习期间发表的学术论文等部分组成。其中正文部分，通常是由引文、摘要、各部分章节、总结等部分组成，正文部分是主要查重的部分，是最为重要的，然后论文致谢、关键词、附录和致谢部分一般也都需要查重。
2、论文查重查的内容大致如上所示，而进行论文查重的直接目的就是为了检测出论文的重复率，从论文重复率是能够判定出论文中存在的学术不端行为严重程度的。论文重复率越高，就说明学术不端行为越严重，各个高校都会规定毕业生论文重复率的合格标准，学历越高，其合格标准越严格。
3、论文查重还会查论文的字数、格式和参考文献等。毕业论文是有最低字数要求的，依各自学校具体规定为准，本科论文一般最低八千字数，硕士论文一般最低三万字数，博士论文普遍都要十几万字数。格式和参考文献也是论文查重检测的重要部分，格式和参考文献不规范的话就会对论文查重结果造成不良影响。
第一、论文查重主要检查论文摘要、关键字、正文、引用等内容，而公式、图表等论文中的非文字内容，大部分论文查重系统都无法查重，因为系统没有开发这种不能进行比对的技术。
第二、对于参考文献，也就是论文中引用的部分，一般都会检测到是否按照规范的格式进行标注，格式不正确的话，可能会计算出重复率，如果引用的内容太多，也有可能将部分内容判定为抄袭。
第三、论文查重检测主要是针对文字，对语句的意义一般检测不出，但论文查重系统能是可以根据语句上下文进行语义识别的，也就是说，如果只是修改极个别的单词，那么论文查重时也有可能判定为重复抄袭。
第四、在进行论文查重的过程中，输入自己的真实姓名，以求更准确的查重论文，因为有的论文查重系统会根据作者的名字来查重该作者以前发表过的论文，然后删除该部分已发表的论文，并计算去除已发表的论文的重复率，以求查重结果更准确。
