论文中的脚注不会查重的，查重主要是针对论文的正文部分。
很多网站都可以做论文查重，但是学校一般只认可权威的知网查重。知网查重的算法一般会检测论文的目录，可以分章检测。然后就会检测论文的摘要以及正文等内容的重复度。
根据权威网站的查重算法，可以知道系统是没有检测图片和公式。一方面这些资料计算机不好进行比对，另一方面论文侧重于文字的检测。这对大多数学生来说是个好消息。
扩展资料：
1、反抄袭软件检测到13个相同的字，就以为是相似，所以连续相似的，不要超过13个字；
2、尽量用同义词代替，例如：损坏=毁坏；渠道=途径；原理=根本思绪；不可见=躲藏；优点特别突出=优势尽显无疑。
3、改动句子的主动语态，比方：数字水印为多媒体数据文件在认证、防伪、防窜改、保证数据平安和完好性等方面提供了有效的技术手腕。=在多媒体制品的认证、防伪、防修改和传送平安以及完好性保证方面，能够采用数字水印的检测作为有力的检测手腕。
参考资料来源：百度百科-查重
大概当今所有的研究生毕业论文都会经过中国知网的“学术不端检测”，即便最后不被盲审。这个系统的初衷其实是很好的，在一定程度上能够对即将踏入中国科研界的硕士研究生们一个警示作用：杜绝抄袭，踏实学问。但正所谓“世界万物，有矛就有盾”的哲学观，中国知网的这个“学术不端检测系统”并不是完善的。原因有二，其一是目前的图文识别技术还不够先进；其二是目前的机器识别还达不到在含义识别上的智能化。求索阁一贯的观点就是“战略上蔑视，战术上重视”和“知己知彼百战百胜”。要破敌，必先知敌；要过学术检测这一关，当然必先了解这一关的玄机。
一、查重原理
1、知网学位论文检测为整篇上传，格式对检测结果可能会造成影响，需要将最终交稿格式提交检测，将影响降到最小，此影响为几十字的小段可能检测不出。对于3万字符以上文字较多的论文是可以忽略的。
对比数据库为：中国学术期刊网络出版总库，中国博士学位论文全文数据库/中国优秀硕士学位论文全文数据库，国重要会议论文全文数据库，中国重要报纸全文数据库，中国专利全文数据库，个人比对库，其他比对库。部分书籍不在知网库，检测不到。
2、上传论文后，系统会自动检测该论文的章节信息，如果有自动生成的目录信息，那么系统会将论文按章节分段检测，否则会自动分段检测。
3、有部分同学反映说自己在段落中明明引用或者抄袭了其他文献的段落或句子，为什么没有检测出来，这是正常的。中国知网对该套检测系统的灵敏度设置了一个阀值，该阀值为5%，以段落计，低于5%的抄袭或引用是检测不出来的，这种情况常见于大段落中的小句或者小概念。举个例子：假如检测段落1有10000字，那么引用单篇文献500字以下，是不会被检测出来的。实际上这里也告诉同学们一个修改的方法，就是对段落抄袭千万不要选一篇文章来引用，尽可能多的选择多篇文献，一篇截取几句，这样是不会被检测出来的。
4、一篇论文的抄袭怎么才会被检测出来？知网论文检测的条件是连续13个字相似或抄袭都会被红字标注，但是必须满足3里面的前提条件：即你所引用或抄袭的A文献文字总和在你的各个检测段落中要达到5%。
二、快速通过论文查重的七大方法
方法一：外文文献翻译法
查阅研究领域外文文献，特别是高水平期刊的文献，比如Science，Nature，WaterRes等，将其中的理论讲解翻译成中文，放在自己的论文中。
优点：1、每个人语言习惯不同，翻译成的汉语必然不同。因此即使是同一段文字，不同人翻译了之后，也 不会出现抄袭的情况。2、外文文献的阅读，可以提升自身英语水平，拓展专业领域视野。
缺点：英文不好特别是专业英文不好的同学实施起来比较费劲。
方法二：变化措辞法
将别人论文里的文字，或按照意思重写，或变换句式结构，更改主被动语态，或更换关键词，或通过增减。当然如果却属于经典名句，还是按照经典的方法加以引用。
优点：1．将文字修改之后，按照知网程序和算法，只要不出现连续13个字重复，以及关键词的重复，就不会被标红。2．对论文的每字每句都了如指掌，烂熟于心，答辩时亦会如鱼得水。
缺点：逐字逐句的改，费时费力。
方法三：google等翻译工具翻译法
将别人论文里的文字，用google翻译成英文，再翻译回来，句式和结构就会发生改变，再自行修改下语病后，即可顺利躲过查重。
优点：方便快捷，可以一大段一大段的修改。
缺点：有时候需要多翻译几遍，必须先由中文翻译成英文，再翻译成阿尔及利亚语，再翻译成中文。
方法四：转换图片法
将别人论文里的文字，截成图片，放在自己的论文里。因为知网查重系统目前只能查文字，而不能查图片和表格，因此可以躲过查重。
优点：比google翻译法更加方便快捷。
缺点：用顺手了容易出现整页都是图片的情况，会影响整个论文的字数统计。
方法五：插入文档法
将某些参考引用来的文字通过word文档的形式插入到论文中。
优点：此法比方法四更甚一筹，因为该方法日后还可以在所插入的文档里进行重新编辑，而图片转换法以后就不便于再修改了。
缺点：还没发现。
方法六：插入空格法
将文章中所有的字间插入空格，然后将空 格 字 间距调到最小。因为查重的根据是以词为基础的，空格切断了词语，自然略过了查重系统。
优点：从查重系统的原理出发，可靠性高。
缺点：工作量极大，课可以考虑通过宏完成，但宏的编制需要研究。
方法七：自己原创法
自己动手写论文，在写作时，要么不原文复制粘贴；要么正确的加上引用。
优点：基本上绝对不会担心查重不通过，哪怕这个查重系统的阈值调的再低。
缺点：如果说优缺点的话，就是写完一篇毕业论文，可能会死掉更多的脑细胞。呵呵。。。
在检测过程中，脚注本身是不参与检测的，如若参与了检测被标红了， 就是脚注格式不正确导致知网没有正确识别 ，脚注的标准格式可以参照百度，也可以问下学校老师。
将论文上传到查重软件之后，查重系统就会根据论文格式对论文内容进行识别，虽然论文脚注重检测的要求并不太严格，但在格式不正确的前提下，查重系统是会进行检测的。因此，大家对于论文脚注是否参加检测还是需要了解的。
每个学校提交的查重内容是有区别的
你们要知道，有的学校只要求提交正文部分，但是有的学校需要提交论文全文（从封面到附录都需要参与检测）。每所高校所要求提交的论文内容不同，因此，论文查重系统的结果也会有一定的差别。但是论文的脚注部分在正文部分，所以一般还会进行查重检测。有些论文查重不会对脚注进行识别，有点系统会进行识别，大家需要注意自己使用的是什么查重系统。
按学校要求修改论文格式
论文的注脚是有格式要求的，如果查重系统能够识别脚注，那么，在格式正确的前提下，查重系统是直接判定这部分是脚注部分，所以这部分可能不会参与检测。在写论文之前，先把这些细节处理好，总体上不会有什么问题。学校会给出标准格式，是要根据自己学校的论文格式修改和调整，这样查重检查就不会出错。
还有很多人不知道论文格式是怎样修改和调整的，所以面对修改后的论文格式，完全不知如何处理。学校都会提供相应的论文格式，大家按照要求进行调整即可。
