论文投稿期刊审核流程如下：
1、首先是初审环节，文章投稿后第一个审稿环节就是初审，初审几乎都是杂志社编辑来完成的，杂志社编辑会对文章进行大致浏览，这时的审核就是简单的浏览，并不会细致深入的阅读文章。
编辑主要看文章的基本写作上有没有问题，比如文章的结构、逻想、主要研究方向与期刊是否相符，是否涉及敏感话题或者字眼。这些没问题通过初审也就没问题。
2、而后是复审，复审也叫外审，是外部审稿专家来完成的，外审主要看文章的研究内容了，因为涉及到专业领域的东西，因此必须由本专业的专家来完成本审稿环节。
需要注意的是，有些刊物需要作者自己推荐审稿专家，一般审稿专家会有3—4位，所有专家审稿意见一致就可以通过外审。
3、最后是终审，终审是杂志社主编对文章的最终审核，这一环节相对于外审通过概率要大得多，主编会对文章进行全面的审核。
这一环节并不意味着没有退稿几率，只不过相对于外审要低一些，以上三个审稿环节是投稿之后文章要经过的三审三校，流程并不算复杂，但通过需要一定时间，因此发表论文务必尽早准备。
如下：
1、根据学术论文内容选择合适的期刊
文不对题的卷子肯定是没分的。投稿也一样，你的东西和杂志社要的东西风马牛不相及，分分钟就给你拒稿了。因此投稿前务必要结合自己的论文内容，选择合适对口的期刊。
举个简单的例子，如果你研究的是肠道，而你把论文投稿到了一个心血管领域的杂志，不用多说，一投过去，就会被人家拒绝。
因此，投稿前，建议多查找google, 梅斯医学等网站，确定我们自己所在领域的相关期刊，挑选几个合适的，放在自己的备选投稿杂志中，再做斟酌。
2、按期刊要求准备相应的投稿材料
投稿材料的构成多种多样，主体上包括一封给主编的信件（cover letter）, 论文的所有文件（包括文字稿，相关图片视频表格等任何支持我们文章的东西），资助的基金信息等。
细节上，每个杂志社会有一些区别，建议大家投稿前多阅读杂志官网投稿界面上的作者须知（author guidelines），细致地了解杂志社对你的稿件包括总体框架，文字格式，图片清晰度，文件大小等的要求，这些都会有细致的描述。
3、上传所有投稿材料文件
在根据期刊要求准备好所有材料之后，我们就可以到投稿网站注册一个个人账户，登录（submission site），开始提交稿件（submit new manuscript）。
投稿系统会要求你依次上传相关文件，填些所有作者信息，填些基金信息等，最后生成一个pdf格式的预览件，这时候我们可以查看整个pdf文件上有没有漏填了一些东西或者一些填些错误，如果存在，可以返回重新编辑。
当检查无误后，就可以确认提交（approve）。此时投稿就结束了，这时候的稿件状态就会显示（Manuscript Submitted）。
4、等待审稿结果及相关处理
投稿之后，会有以下流程，当然不同期刊，不完全相同。
过了三到四天，稿件会先到主编手里，这时候显示With Editor，如果主编认可你的文章，那么就会分配给副编辑（associate editor），状态就会显示Under Review。
审稿的时间根据不同杂志有2周到几个月不等，这时候associate editor就会把文章另外发送至两到三个审稿人，这就叫送外审。
过了漫长的等待期，状态变为Required Review Completed，这时候表明审稿已经结束了，associate editor已经整理审稿人的意见并给出自己的意见发送回editor了。
最后，你的稿件又重新回到了editor手中，这时候状态就会显示Decision in Process，editor会根据返回的审稿意见，召集编辑们讨论，最终确定结果。
返回的可能结果：
Accept 直接返回接收的可能性一般很小，往往都会有一些意见。
minor revision 传说中的小修。
major revision 传说中的大修。
这两种情况，需要根据返回的修稿意见逐条核对，该补实验的补实验，该改文章的改文章，从而达到审稿人的要求。返回杂志社时，会重新送到审稿人手中，再进行一轮审稿。
reject 拒稿。原因包括东西不符合我们的要求，稿件的质量欠佳等等。这时候你就要退而求其次，选择备选杂志中的其他要求降低的杂志进行再次投稿。
先初审后复审最后终审。
初审：收到文章后一般会有征稿或执行编辑对论文进行格式与材料等初审；初审主要简单审核稿件是否符合本刊要求，审核作者资历和单位信息。
复审：初审通过后会发给主编，主编看过后会进行评估，如果认为文章达到本社的基本要求就再把稿子递给领域相近的编委编委会根据论文主题来邀请审稿人进行复审。
终审：一般到了这一步，没有什么大问题的话基本不会退稿的。总编对标题、版式、内容审核后提出修改意见或批清，投稿者就按照杂志社的要求最后改改便完成了。
