要看你索引的字数以及你们学校的规定。索引的字数不要太多，最好不要大段大段的引用，而且也得看你们学校的规定，有的学校查重的时候只看抄袭率，有时你引用自己的也算抄袭，的确很无奈。有的学校查重的时候会看你引文的出处，批注也是文本信息的一种，将和正文一样保存在文档里。
算重复，引用部分如果重复度太高，一样属于非主观意识的抄袭。
因为往往就是这些引用的专业术语造成了论文重复率偏高的现象，所以，要降低一篇论文的重复率，就必须对引用的专业术语部分进行结构或者语句陈述方面的调整，这样的话，重复率问题便不再是问题。
在一篇学术研究课题当中，论文所引用的部分会非常的多，因为论文的专业度要求高，其中很多公式、函数、专业推理，都必须进行通过书本或者专业课程的引用来完成，但是也必须做降重处理，比如将公式放在不同的位置。
写作指导
毕业论文只能有一个主题（不能是几块工作拼凑在一起）。
这个主题要具体到问题的基层（即此问题基本再也无法向更低的层次细分为子问题），而不是问题所属的领域，更不是问题所在的学科，换言之，研究的主题切忌过大。
因为涉及的问题范围太广，很难在一本硕士学位论文中完全研究透彻，通常硕士学位论文应针对某学科领域中的一个具体问题展开深入的研究，并得出有价值的研究结论。
PaperBye论文查重软件目前分两个版本，一个是标准版(免费版)，一个是旗舰版，标准版8个比对数据库，旗舰版12比对数据库。
使用方法如下：
第一步，打开paperbye官网用微信扫码关注公众号登录
第二步，登录成功后，选择永久免费标准版本，上传需要查重的论文；
第三步，提交成功后，点击“查看检测报告”即可；
第四步，如果需要进行论文在线改重或机器降重，可以在查看报告列表查看
根据自己需求，在线改重，如果报告比例较高，自己进行修改的话，可以在报告里一边修改一边查重，及时反馈修改结果；机器改重，就是软件辅助自动修改文章降重，可以辅助自己提供论文修改效率。
论文查重是检测论文相似内容的手段，最终的还是通过论文降重进行
人工降重方法:
1、变换表达。先理解原句的意思，用自己的话复述一遍。
2、词语替换，在变换表达方式的基础上结合同义词替换，效果更好。
3、变换句式，通过拆分合并语句的方式进行修改，把长句变短句，短句变长句。
4、图片法，针对专业性太强不好修改的语句或段落（比如计算机代码，法律条款，原理理论等），可以适当把文字写在图片上展现，但是这种方法不宜用的太多。知网查重系统不太合适，可以识别图片，公式，表格，其他查重系统可以适当使用。
5、翻译法，用百度翻译或谷歌翻译，中文翻译成英文，英文翻译成日语或其他语种，再从日语翻译成中文，这种看似不错，还得需要人工润色，感觉效果还是鸡肋，适当用用也无妨。
机器降重方法：
论文降重软件只是辅助手段，最后还得人工润色一下，完全降重有效的没有。
PaperBye论文查重系统里有自动降重功能，可以作为你查重后修改参考的一种辅助手段。
关于效果，针对专业不同效果也不一样，比如理工科或专业术语比较多的，改的效果不太好。如果一些文课类文章，改好后语句还是蛮通顺的，效果没有人工修改好，但是可以给一些修改建议提示，也是不错的，主要看怎么使用。看看下面修改的例句，降重效果还算满意。
最后提醒一句，软件论文降重，只是辅助，即使改好了，也需要人工去复核修改一遍，因为毕竟是软件，有的表达上会欠缺妥当，需要人工润色。同时也不要过度依赖软件降重，目前还是没有人工一字一句修改的效果好，只能作为一种改重的辅助手段，不要期望过高。
每个查重平台获取到的每份论文查重报告都是带有一个查重编号，所以，检测完成后我们是可以使用这个论文查重报告的唯一查重报告编码在对应的查重平台官网进行验证，这个查重编号有利于避免你的论文报告被伪造或者有不法分子直接通过登录平台后窃取你的论文用于其他用途。一般论文查重报告查看可以在网页上直接查看，如果确实需要下载，那么下载下来的查重报告格式都是PDF格式。论文查重报告最重要的是对论文重复率的批注和对应的出处查询，一般在论文查重报告中，查重报告会根据重复相似的程度使用不同的颜色进行标注。
通常红色和橙色字体表示的是重复内容，提醒你这些都是需要修改的，而绿色字体则表示是合格的暂未发现有重复。
绿色：原创部分，表示没有检测到相似语句;
红色：重度抄袭部分，相似度70%~100%，强烈建议修改;
橙色：轻度抄袭部分，相似度40%~70%
当然不同的论文查重系统，标注会有一定的差异，但是在论文查重报告中一般都会有说明，不同颜色代表什么样的意思，我们只需要仔细查阅就可以。最后预祝大家全文飘绿，顺利通过。
