保密的一般是与涉密项目有关的论文，即常规涉密内容，如：涉密的国家自然科学基金项目（以下简称“国自然”）、涉密的国家重大社会科学基金项目等；或者是其他涉密内容，如：涉密的国家重点实验室、涉密的军事院校等。
其中，涉密项目一般都有保密期，国自然一般保密期是3-5年，也有更长的，随项目时间顺延，在保密期过后会随当年硕、博士论文一同录入知网；如果是其他涉密内容，则可能只在内网交流，公开时间另行规定（或有限公开、甚至不公开）。
过了保密期后才会在网上公开，也就是说还在保密期的论文是查不到的，自然就不会和保密期的论文查重了。
论文查重的时长主要取决于查重系统的检测能力、比对数据库的大小、论文的类型和篇幅。查重系统的比对库越大，在检测论文重复率时需要比对的数据就越多，查重时间的会更长;论文查重系统比对这些数据的效率也是影响查重时间的关键，处理这些数据的能力越强，查重的时间就越短;论文的类型和篇幅对查重时间也有影响，博士论文等一些篇幅较长的论文，因为需要检测的内容比较多，所以查重时间也会适当延长。论文查重并没有一个固定的时间，主要看我们选择什么查重系统。
查重整篇论文，其检测完成的时间通常都需要20分钟。不过论文查重时间也会受多种因素所影响，这些因素包括有论文字数、系统数据库、查重人数以及提交论文时间段等。如果论文字数比较少，比如一篇只有5000字以内的论文，可能论文查重时间所花费的时间还不用20分钟，十几分钟就能够检测完成。
如果是篇幅比较长字数比较多的毕业论文，论文查重时间往往都会超过30分钟，特别是字数好几万甚至十几万或者几十万的硕博研究生毕业论文，完成论文查重的时间可能会超过120分钟。如果提交论文进行论文查重的人数有很多，已经达到论文查重系统所承受的上限，那么必然是会对大家论文查重完成时间造成一定影响的，会自动进入排序队列等待系统的查重检测，就会延迟拖长论文查重的时间。
论文查重时间的长短跟论文查重速度也有着很大的关系，很多论文查重系统检测论文的速度其实并没有太大的区别，因此其论文查重完成的时间差距也并不大。但是，如果是在论文查重高峰期的话，会有很多人提交论文至论文查重系统，这时论文查重时间就会延长很多，可能会有卡顿现象，因此我们想要快速完成论文查重的话，最好是避免在论文查重高峰期提交论文检测。
知网查重对比截止日期就是某个人的论文必须得在这个截止日期之前进行查重。就拿大学来说吧，大学生即将毕业，都要交一篇毕业论文，同时该学校也会通知学生必须在查重截止日期之前进行查重完成，如果没有进行查重，该名学生将无法进行答辩等一些重要的环节，最终将会影响毕业。
所以，大学生在毕业之前就应该在网上了解查重对比截止日期，同时也应该在网上多练习一下步骤，熟悉一下流程，这样在真的查重时得心应手，不会手忙脚乱，同时查重结果出的快也有利于你修改论文，减小查重率，从而为更好更顺利的毕业打下夯实的基础！
你的毕业论文最终会上传到知网你们学校校库里面去。学校的校库在知网是不公开的，你的论文最开始查重的时候是和知网全网对比查重的，等到最后一次查重，是和你们校库对比查重的，而且这都不是重点，重点是你的论文不会和你一起毕业的这一届同学横向对比查重（包括和你同一个课题组的）这些都不在查重范围内，所以看到这里应该懂我意思了吧！
不过，如果你的论文和知网之前收录的内容重复的地方比较多，那么，即使校内同专业之间不比对，你的论文重复率还是会很高的。
