版权肯定是你的，但目前的情况就这样，与现行的论文版权制度有关。
知网等论文数据库认为，我整理、检索、存储这些文章，需要成本，所以就需要付钱。
也就是说，论文付钱，付的是整理、检索文章的服务费，而不是为文章本身付费。
比如万方，用户协议里面写着呢，"未经明确授权许可，用户不得进行复制、修改、出租、散布或衍生其他作品，或用以商业性目的。"
这里的问题是：这些论文真的归这些数据库所有吗？如果不归你所有，你有什么权力限制他人传播？这就是论文版权制度不合理的地方。当作者写出论文以后，向杂志社投稿，论文的版权仿佛就归杂志社了，进而莫名其妙变成了某些数据库公司的财产。
这是目前，国内（或者说国际）存在的问题。我期待着改变，但目前看来，遥遥无期。
真的希望，论文是世界民众的共有资源。
参考
另，你追加的此类问题十分普遍。
硕士论文答辩后及毕业前有个程序，就是到图书馆提交电子的硕士论文，那样就全部保存在图书馆了，再由中国知网、万方收录。所以我觉得所有人的论文都是有收录的，只不过有的论文只收录了一部分，需要全文的话需要向本校图书馆提交申请
在知网查不到自己的论文可能有两个原因：
一、因为自己发表的刊物不在知网录入
有的期刊全文被知网录入，有的刊物则是被万方数据库、龙源等数据库录入，这样的话，在知网当然查不到自己期刊。发表刊物前，先确认自己要发表刊物是否被知网录入，避免影响职称评定。
二、时刻太短，还没被知网录入
收到样刊，但是被知网录入仍是要有一段时刻，一般在拿到样刊后3个月左右，文章才会被录入到知网上。
知网修改每天要处理很多的论文数据，所以，论文上传需要时刻，不同的期刊，录入和公开介绍的时刻是不同的。作者需要提早了解清楚，根据详细时刻安排好自己论文。
