1、论文内容主要包括：封面、声明、中英文摘要、目录、主要符号对照表、正文、致谢、参考文献、附录、原创性声明或者授权声明以及学习期间发表的学术论文等部分组成。其中正文部分，通常是由引文、摘要、各部分章节、总结等部分组成，正文部分是主要查重的部分，是最为重要的，然后论文致谢、关键词、附录和致谢部分一般也都需要查重。
2、论文查重查的内容大致如上所示，而进行论文查重的直接目的就是为了检测出论文的重复率，从论文重复率是能够判定出论文中存在的学术不端行为严重程度的。论文重复率越高，就说明学术不端行为越严重，各个高校都会规定毕业生论文重复率的合格标准，学历越高，其合格标准越严格。
3、论文查重还会查论文的字数、格式和参考文献等。毕业论文是有最低字数要求的，依各自学校具体规定为准，本科论文一般最低八千字数，硕士论文一般最低三万字数，博士论文普遍都要十几万字数。格式和参考文献也是论文查重检测的重要部分，格式和参考文献不规范的话就会对论文查重结果造成不良影响。
是不进行查重的，系统会自动的去除，但是格式一定要设置正确
论文参考文献随便写查重会被查出来。
如果论文中有引用别人的原文，在查重时是会被标注出来的，格式一定要正确才不会被查重系统视为抄袭;若没有进行标注的话，查重系统是会检测到引用论文的参考文献，就会把这段文字作为正文进行查重检测。
如果出现了标红的现象，那也许是因为参考文献的格式不标准，格式不标准的参考文献查重系统是无法进行识别的，就会被当做正文进行查重检测。
当然，只要论文作者不过多地引用文献内容，参考文献占用论文的比例就不会太多，也就不会对论文的质量以及重复率产生不良的影响。
如果当查重后发现自己论文的参考文献甚至是连论文的目录都被标红了，那么就需要去排查问题的原因了，基本上会发生这种情况都是由于我们在排版的时候格式不规范才导致的。
比如论文当中的脚注并非使用word自动插入，参考文献的格式设置有问题的话，那么就会导致查重系统无法去正确的识别，这样就会把这部分的内容当成是正文内容从而进行检测，这时只需要按照正规的论文格式去重新编辑下就行。
