不可以。经过授权仿真软件的版权可以写毕业论文，没经过授权不可以写毕业论文。毕业论文按一门课程计，是普通中等专业学校、高等专科学校、本科院校、高等教育自学考试本科及研究生学历专业教育学业的最后一个环节，为对本专业学生集中进行科学研究训练而要求学生在毕业前总结性独立作业、撰写的论文。
硕士论文不上知网的原因是：高校没跟知网合作。
无论硕士还是博士，毕业论文里一般都会有一页授权书，要求论文作者授权高校使用论文。因此，如果知网没有从论文作者那里得到授权，而且高校本身和知网也没有合作，那么该校硕博学位论文就不会上传知网公开。
知网是一个企业，不是国家部门，不存在强制获得高校学位论文的可能。这个买卖必须得双方自愿，是否上传知网是高校的自主选择。有些高校有自己的学术论文数据库。比如万方数据库就是北京大学自己建的，那自然就很少上传论文到由清华控股的中国知网。
也有一些高校是因为知网收费太贵不愿意与知网合作。每逢毕业季，学生们就抱怨知网：黑心，查重贵，收费贵……知网收费贵已是学术界尽人皆知的事实。动辄几百的查重费用更是每年毕业季被热议的话题。然而，骂了这么多年，知网收费竟然越骂越贵，端的是：任你风起云涌，我自岿然不动。
没有收入来源的学生负担不起使用知网的费用，很多高校也负担不起，叫苦不迭。2016 年1月，武汉理工大学曾因知网涨价过高而暂停订购知网；同年3月，北京大学也因为知网过快的涨价行为而暂停订购知网。随手一搜，各大学和图书馆暂停知网访问的公告比比皆是。
毕业论文的著作权是学生的，只是学生在提交论文时通常会给学校一个授权委托书或是声明之类的，授权学校可以经一段时间后公开，免费使用。通常而言，指导老师会对论文提一些意见，学生出于对学校的感情出发，也默认了这种行为，而且学校有后置手段，不授权通常不给办理离校手续。但从权利的角度来看，学校是无权强制学生授权的。
