硕士论文不上知网的原因是：高校没跟知网合作。
无论硕士还是博士，毕业论文里一般都会有一页授权书，要求论文作者授权高校使用论文。因此，如果知网没有从论文作者那里得到授权，而且高校本身和知网也没有合作，那么该校硕博学位论文就不会上传知网公开。
知网是一个企业，不是国家部门，不存在强制获得高校学位论文的可能。这个买卖必须得双方自愿，是否上传知网是高校的自主选择。有些高校有自己的学术论文数据库。比如万方数据库就是北京大学自己建的，那自然就很少上传论文到由清华控股的中国知网。
也有一些高校是因为知网收费太贵不愿意与知网合作。每逢毕业季，学生们就抱怨知网：黑心，查重贵，收费贵……知网收费贵已是学术界尽人皆知的事实。动辄几百的查重费用更是每年毕业季被热议的话题。然而，骂了这么多年，知网收费竟然越骂越贵，端的是：任你风起云涌，我自岿然不动。
没有收入来源的学生负担不起使用知网的费用，很多高校也负担不起，叫苦不迭。2016 年1月，武汉理工大学曾因知网涨价过高而暂停订购知网；同年3月，北京大学也因为知网过快的涨价行为而暂停订购知网。随手一搜，各大学和图书馆暂停知网访问的公告比比皆是。
确实拥有别的选择。
众所周知，每一位学生毕业时都会使用到论文查重网站，其中，最热门的论文查重网站包括知网。近年来，许多高校老师状告知网，可是知网却依旧保持着高冷的姿态，每个年的VIP费用特别高。现如今，中科院决定停止使用知网，我国还拥有着许多可以替代知网的论文网站。最著名的论文网站包括万方、维普和中国期刊网。
一般情况下，大部分的学生还没有找到正式的工作，吃穿费用来自于父母。每到论文答辩季节，孩子们需要通过正规的网站完成论文查重。一般来说，正规网站的VIP费用特别贵，尤其是知网。为此，学生需要结合多种资源才能够完成论文查重。在此基础上，滋生了许多乱象，例如许多网络电商平台出售知网账号。久而久之，学生的经济负担加重，可是知网却一直没有降价。
每个行业中都有龙头软件和企业，以论文查重行业为代表，知网成为许多网友特别清楚的论文查重网站之一。可并非所有的论文查重网站都可以获得巨大的知名度，万方和中国期刊网可以为学生提供论文等服务。只不过两大网站缺乏曝光度和知名度，这也导致人们无法在第一时间了解到相关网站的具体信息。只要人们用心观察，总可以体会到网站替代品。
总的来说，知网确实可以让我们获得最直观的论文查重率，但是知网也会影响着学生生活和教授论文发表。前者缺乏大量的资金，或者无法获得充足的稿费。尽管如此，知网依旧保持着高收费，最终中科院决定停用知网。
论文查重应该不一定要用知网，当然现在知网查重系统的普及率是最高的,硕士、博士毕业论文所有高校都是使用的知网vip5.3/tmlc2版本,而本科大部分高校使用的是知网pmlc版本。但并不是全部高校使用知网,有少部分学校对本科毕业论文还是使用维普和万方,毕竟价格相对较低。
