在系统里查重。
硕士论文外审会看到查重报告，也就是说你的硕士论文会和你的论文查重报告一起发送给你的论文审稿专家，审稿专家综合你的查重报告以及你的论文主要内容进行审理。
在查重率较低的情况下，主要审查你的论文工作量，使用方法和论文撰写的合理性等。
一般是电子版，具体的要看要求而定。
论文送审就是将写好的论文上交，等待审核，通常是用查重系统进行论文查重。关于论文送审，也有很多人在问，论文送审是电子版还是纸质版?目前来说，更多的是电子版的，因为电子版的传送接收也更方便；不过也有个别的要求是纸质版的。所以电子版的还是纸质版的要看作者所提交的期刊要求。
论文纸质投稿和电子投稿有很大的区别，就拿投稿效率来说，纸质投稿的需要邮寄，周期长，电子投稿一般都是在线投稿，效率高，可以节省作者的投稿时间。而且论文的发表，投稿是占据重要的一个环节，除了选择合适的期刊，投稿方式也是很重要的，如果投稿投的好，就能又省心又省力。
毕业论文外审通过了还会查重的。
。外审只是其中的一个环节，是为了避免本校审核中避不开的人情关系，相对的保证公平公正，而抽查也只是其中的一个环节。
通过随机的抽查，不仅仅能看出论文的规范性，质量等，还能对之前的环节是否严谨进行考量。
一、两者的实质不同：
1、论文盲审的实质：匿名送审。
2、论文查重的实质：防止论文作假。
二、两者的相关要求不同：
1、论文盲审的相关要求：盲审制度，就是将不署作者名的学位论文送给作者不可能知道的专家审核，这样打出来的分数，应是最为客观。一般高校，特别是研究生院，均有对学位论文进行定期盲审的相关规定，多为随机抽取一定数目的论文进行盲审。
2、论文查重的相关要求：一般高校将重合度30%以上定为抄袭的文章，即论文审核不通过。
三、两者的概述不同：
1、论文盲审的概述：指一种组织专家组评审的制度，就是匿名送审，意味着评阅导师不知道论文作者是谁。
2、论文查重的概述：把写好的论文通过论文检测系统资源库的比对，得出与各大论文库的相似比。
参考资料来源：百度百科-查重
参考资料来源：百度百科-论文重合度
参考资料来源：百度百科-盲审
