是中文核心期刊，也是EI收录期刊。
不是SCI，也不是EI
《上海交通大学学报(医学版)》(原《上海第二医科大学学报》)为医药卫生类综合性学术期刊，创刊于1958年，月刊，每月28日出版，国内外公开发行。本刊以引导科技发展，培养学术人才，增进学术交流为办刊宗旨。刊登医学基础、临床、公共卫生等领域所取得的新成果、新理论、新技术、新经验；设有论著、综述、专题、专家论坛、述评、短篇论著、技术与方法、病例报告等栏目。
本刊为中国科技核心期刊、中文核心期刊、中国高校优秀科技期刊，主要被以下著名数据库收录：俄罗斯《文摘杂志》（AJ）、荷兰《文摘与引文数据库》（Scopus）、荷兰《医学文摘》（EMBASE）、美国《化学文摘》（CA）、美国《剑桥科学文摘（自然科学）》（CSA:NS）、日本科学技术振兴机构中国文献数据库（JSTChina）、中国科技论文与引文数据库(CSTPCD) 统计源期刊(中国科技核心期刊)、中国科学引文数据库（CSCD）核心期刊、中国生物医学文献数据库、《中国学术期刊评价研究报告》(RCCSE)核心期刊、中国学术期刊综合评价数据库及《中文核心期刊要目总览》。
医学核心期刊有如下：《FRONTIERS OF MEDICINE》《解放军医学杂志》《解放军医药杂志》《医学研究生学报》《中华医学杂志》。
医学核心期刊是对以公开发行的医学学术期刊，按学科分门别类的进行系统评价的医学学术期刊目录，通常所说的核心期刊，是指被北大图书馆每四年出版一次的《中文核心期刊要目总览》中列出的期刊。
医学核心期刊主要以北京大学图书馆出版的《中文核心期刊要目总览》 也叫2011版北大中文核心。中国科学技术信息研究所出版的2014年中国科技论文统计源期刊(中国科技核心期刊)目录为参照标准，
同时各地高校和卫生机构根据各地的需要按期刊的影响引子等条件将医学类期刊分为一类、二类或者A、B、C、D等，这种分类方法由于各地的要求不统一，所以没有统一的标准。
核心期刊 第五编 医药、卫生
R 综合性医药卫生
R1 预防医学、卫生学
R2 中国医学
R3 基础医学
R4/8 临床医学/特种医学
R9 药学
综合性医药卫生类核心期刊
1、中华医学杂志
2、第四军医大学学报
3、第三军医大学学报
4、第二军医大学学报
5、第一军医大学学报（改名为：南方医科大学学报）
6、解放军医学杂志
7、北京大学学报.医学版
8、吉林大学学报.医学版
9、四川大学学报.医学版
10、中国医学科学院学报
11、中国现代医学杂志
12、复旦学报.医学版
13、华中科技大学学报.医学版
14、中山大学学报.医学科学版
15、中南大学学报.医学版
16、西安交通大学学报.医学版
17、浙江大学学报.医学版
18、南京医科大学学报.自然科学版
19、广东医学
20、军事医学科学院院刊
21、上海第二医科大学学报（改名为：上海交通大学学报.医学版）
22、上海医学
23、郑州大学学报.医学版
24、江苏医药
25、山东大学学报.医学版
26、中国医科大学学报
27、实用医学杂志
28、山东医药
29、哈尔滨医科大学学报
30、重庆医学
31、重庆医科大学学报
32、天津医药
33、安徽医科大学学报
34、苏州大学学报.医学版
35、武汉大学学报.医学版
36、首都医科大学学报
37、医学与哲学.人文社会医学版
预防医学、卫生学类核心期刊
1、中国公共卫生
2、中华医院感染学杂志
3、中华流行病学杂志
4、卫生研究
5、营养学报
6、中华预防医学杂志
1、结构工程、防灾减灾及防护工程、现代结构理论学科
2、岩土工程学科
3、桥梁与隧道工程学科
4、土木工程建造与管理学科
