1、测序反应开始及最后都不是很稳定，表现在测序结果上就是如此了。
2、SNP在测序结果上的表现是该位点处为双峰。因为其他地方序列都是一样的，末端终止得到的片段也就是完全一样的，只有在SNP位点处才会得到两种片段。
问题一：测序结果怎么分析 测序结果的分析
测序都是从5端进行的，正向和反向测序是指对DNA的两条互补链分别测序，通常两个方向测序结果经校读后完全一致才能认为得到可靠结果。生工测序结果一般都提供两个文档，一个是TEXT的序列文档，一个是用Chromas软件打开的ABI文档。
1.寻找引物
blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 比对，去除引物序列，找到目的片段。
在DNAMan上进行比对，看引物能不能比对上（一个不变，一个反向互补），如果比不上，那可能就不是你要的序列，如果能比上，上游以引物第一个为分界线，去除前面的；下有一最后一个为分界线，去除后面的，剩下的就是目的序列。然后在NCBI上Blast.就OK了。
批注：PCR产物进行测序的结果可能不包含引物序列
2.将找到的对应目的片段转成*.txt格式
3.下载BioEdit软件
第一：打开Bioedit软件，导入拼接好的样品序列与标准亚型参考序列
File New Alignment Sequence New Sequence 导入拼接好的样品序列和标准参考序列（从TEXT文档利用复制粘贴工具） Apply and close 保存结果 关闭窗口
第二：点击菜单栏上按钮 Accessory Application ，选择 Clustalw Multiple Alignment
File Open Accessory Application Clustalw Multiple Alignment
第三：比对结束后，删除比对序列两端的多余序列，使所有序列等长
选择需要编辑的序列 Sequence Edit Sequence 进行序列的编辑 保存修改后结果
第四：选择 Sequence 菜单下的 Gaps ，点击 Lock Gaps
第五：将比对后的序列保存为Fasta 格式文档
4.下载MAGE4.0软件
1) 打开MEGA软件，选择 File 菜单栏中的 Convert To MEGA Format ，把序列文件的格式转换为meg文档保存；
2) 双击序列的meg文档，选择 Nucleotide Sequences ，点击 OK ；
3) 程序运行中询问是否为蛋白编码序列，选择 NO ；
4) 在MEGA操作界面选择 Phylogeny 菜单栏下 Bootstrap Test of Phylogeny 中的 Neibour-Joining ；
5) 选择 Test of Phylogeny 栏中的 Bootsrap ， Replications 设定为1 000；在 Options Summary 栏中的 Model 项中，设定参数为 Kimura 2-Paramete r，最后选择 pute ；
6) 将分析结果采用Los Alamos HIV序列库提供的HIV-BLAST和Subtyping工具进行验证。...>>
问题二：dna测序结果分析怎么看进化图 如果是用Sanger测序的话，电泳得到的条带是模板连的互补链，电泳的方向是有3‘段到5’段的，那么从下往上读，就可以的出互补链，根据反向平行，就可以推倒出模板连的碱基序列。
问题三：怎样分析基因测序结果 1.假设你测的是一个基因的序列,如果已知这个基因的序列,则将你测序得到的基因序列与已知的序列相比对,分析看两者在哪个地方不对应,不对应的地方即为突变的地方.比对的软件有sequencher,或者去NCBI网站点击BLAST进行.
2.如果你测的是一个以前未知的序列,那么要测几个不同的单克隆,将测得的结果进行比对,分析一致的地方以及不一致的地方.
问题四：细菌基因组重测序结果分析报告怎么看 测序只是最基础的，接下来你要做功能基因分析，查找确定哪一些是编码基因的序列，然后做表达检测。。 如果你事先知道自己的目的基因序列，测序结束后，应该可以直接找到。
问题五：高通量基因测序检验报告单怎么看 哪个公司出的，可拨打他们的客服电话。从业人员素质普遍较高，可以很详细解答您的疑问。
问题六：如何看测序的结果与预期相差很大 先注意染色体与基因的关系，一条染色体有多个基因。
所以基因结构变异（碱基对增、减、变）导致一个基因变。染色体结构变异，导致多个基因的重复，缺失，排列顺序的改变等。所以基因突变是某一性状改变，而染色体变异是某一系列性状的改变。
如果太多，就选择你要进行具体分析的放到论文里面，可以采用纸张横向。
发表文章的话，测序基因必须上传
测序公司给出的测序结果包含两部分：一是测序结果,二是测序对应的信号波峰,信号主要是反应测序结果的可靠性的.
如上图所示,信号很好,那就说明测序没有问题.你可以大胆的进行序列比较,也就是alignment.
我用DNAMAN给你演示一下吧 首先依次点击file-open special-AB1/SCF trace 打开扩展名为.ab1的测序图谱,查看没有问题.
接下来序列比较：依次点击sequence-alignment-mutiple sequence alignment 出现一个对话框 ,点击file添加扩展名.seq的基因序列----就是你所说的（目的基因序列,野生型和突变型）,选DNA,按提示下一步直到完成.对比结果就出来了.
