因为它们之间有着很多的对立面，就是因为这些对立面，让它们之间不管什么时候都会有争论，具体对立面下面详细分析：
一、利益关系不同，中西医背后的利益不一样。
中西与西医之间，除了诊断以处，最大的不一样就是药物，中医的药物与西医是不一样的，他们关系到的药企的资质申请及操作流程都不同，价格自然也就不一样；像中西的颗粒、口服液、丸剂、酒剂，西医的粉剂、针剂、疫苗，这些完全不一样的利益关系。
按理说，就生产来讲，它们应该是井水不犯河水，相辅相承，撕不起来才对。但是因为双方各方面的定价及原材料的相同，在竞争的时候本身就是一场硬仗，于是中医与西医在利益上就开始有了第一个冲突。再加上在医院科室上的不同，又开始第二次利益之争，所以争论也就存在了。
二、中医是传统文化，西医是外来文化。
不管怎么说，外来文化与传统文化之间都是有争论的，比如汉服与西装、凤冠霞帔和婚纱、握手与抱拳等，都是争论的对象，中医与西医之间除了形式以外还代表着文化，就算在学校，也是有系统的学科的，它们之间的争论只多不少，又如何能够逃得过？
更何况，中医传承了几千年，但是它的发展因为流派之争的关系，已经杂乱无章，系统的中医学的人又少，远远没有西医学的人多。但是奇怪的也就这一点，其他的争论都是圈内人在争，中医与西医之间，反倒是中西医病人之间的争论更多，也算是两大学术争论之间的独有现象了。
三、推广度不一样，中医推广力不高，西医较为普遍。
中医其实是很系统的，但是不知道什么时候开始，变得藏私了起来，并且也不爱宣传，收弟子还得看顺不顺眼，慢慢的变得越来越少。到后来终于开始设立国学馆推广的时候，已经让民间很多挂着中医名头的骗子坏了几千年来的名声，要把这个名声重新拉回来，还得有很长的路要走。
而西医则较为系统，它该是什么就有什么，它的各类学术都有系统的让人能够快速入门的优势，所以它能够广而推之，并且在各大学院及医院，都有大部分的西医入驻，这些人与中医的比例，或许都能超过7：3。但是也是没有办法，中医目前的入门知识，还需要有更系统的教学方式。
当然，它们的争论虽多，但是两者之间该去认可对方的优点，比如说西医里断肢再续、设备、手术等，都是比中医领先的，中医需要认可；而中医里，对调和这一点较有优势，虽说能够做到效果，但是在理论上却未能跟上，这点也需要改进。两者都是救人的医学，应该相辅相承，而非敌对。
国内杂志一般都只有一个一作，跟编辑说说好话或许会给两个一作，但中文期刊影响力太小，第二个一作基本就是二作了，所以编辑很多情况下不会同意。
《中国中西医结合杂志》编辑部 成立于1981年，1989年改为中国中西医结合杂志社。现出版《中国中西医结合杂志》（中文版）、《CHINESE JOURNAL OF INTEGRATIVE MEDICINE 》（中国结合医学杂志，英文版）；曾出版《中西医结合》（日文版）、《中国中西医结合杂志》（韩文版）。
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随着科学规模的不断扩大，在研究所需经费急剧增加的同时，科学成果到实际应用的距离也越来越短，纯科学与应用科学的界限日趋模糊。这使得科学成为了一种可能带来巨大经济效益的投资对象，使科学研究中的利益冲突，表现更为突出。利益冲突及其主要形式如下：
1、在个人利益与其所属组织P应有的利益之间存在（或个人认为存在）实际的或潜在的冲突时。
2、当个人的经济利益或其它利益与其所应遵循的职业规范或相应义务发生矛盾时，便可能产生利益冲突。
避免利益冲突的方法：
对于从事科学研究的科学家来说，利益冲突是指这样一种境况，在这种境况下，科学家的某种利益具有干扰他在科学活动中作出客观、准确、公正的判断的趋势。
协调多种利益、控制利益冲突的关键是排除因各种利益而带来的偏见和错误。许多国家关于科学研究的道德规范和相关政策中，对与工业合作研究中的利益冲突以及在兼职、同行评议等活动中的利益冲突有比较具体的规定。
从原则上而言，公众所提供的应当用于基础科学研究的资金不能用于私人的经济利益，因而两者必须确立透明的职责清晰的合同关系，则可以避免利益冲突。
中国结合医学杂志是一本英文版刊物，刊名为Chinese Journal of Integrative Medicine，目前为SCI期刊、CSCD来源刊物。《中国结合医学杂志》是经国家新闻出版广电总局批准，国家中医药管理局主管，中国中医科学院、中国中西医结合学会主办，国内统一刊号：CN11-4928/R，国际标准刊号：ISSN1672-0415，邮发代号：82-825。
