截至2015年4月，学校拥有国家工程技术研究中心1个，省部共建国家重点实验室培育基地1个，省部级及以上重点实验室（研究中心）11个，其中包括省部共建教育部重点实验室1个、省部共建教育部工程研究中心1个、卫生部研究中心1个、卫生部重点实验室1个、浙江省重点实验室7个。 国家工程技术研究中心：国家眼视光工程技术研究中心省部共建教育部工程研究中心：现代眼视光技术和装备教育部工程研究中心卫生部研究中心：卫生部视光学研究中心国家重点实验室培育基地：眼视光学和视觉科学浙江省重点实验室：浙江省眼视光学重点研究实验室浙江省医学遗传学重点实验室浙江省眼视光学重点研究实验室浙江省生物技术制药工程重点实验室浙江省模式生物技术与应用重点实验室浙江省麻醉学重点实验室浙江省神经老化与疾病研究重点实验室省部共建教育部重点实验室：检验医学卫生部重点实验室：卫生部视觉科学研究重点实验室协同创新中心浙江省“2011协同创新中心”：眼视光行业产业协同创新中心 馆藏资源截至2015年4月，图书馆总藏书量215万余册，拥有丰富的纸质中、外文图书和期刊，并拥有各类数字资源，内容涉及全文期刊、文摘题录、学位论文、会议论文、百科全书、电子图书、考试学习平台、光盘镜像、视频等多种类型。形成了以医学为中心，兼及理、工、农、文等学科门类、符合学校办学需要的馆藏体系。 学术期刊《温州医学院学报》，国家科技部“中国科技论文统计源期刊”（中国科技核心期刊）。《眼视光学杂志》是中国惟一的眼视光学专业的学术期刊，该刊2000年获得浙江省优秀期刊一等奖，2001年被国家新闻出版署、国家科技部评为“中国期刊方阵双效期刊”，2002年被评为华东地区优秀期刊，并再次获得浙江省优秀期刊一等奖。 《肝胆胰外科杂志》由浙江省教育厅主管、温州医学院主办，经国家新闻出版总署批准向国内外公开发行的综合性医学学术期刊。《浙江创伤外科》由浙江省教育厅主管、温州医学院主办，公开出版的科技期刊。
温州医科大学其实综合实力并不是很强。根据2017年第四轮学科评估，温州医科大学得分情况如下：基础医学：C-临床医学：B-口腔医学：C-药学：B-护理学：C这个成绩的确不太好看。即便是排名最靠前的，得分也只有B-，相当于国内参评院校的前30%～40%，勉强算是中游偏上水平的。
不过温州医科大学的名气很大。如果你的成绩考那些排名很靠前的医学院校有难度，那么温州医科大学还是值得考虑的
