我投过的只有一个没收版面费，是Journal of Bioinformatics and Computational Biology ，收算法类的文章，对英文要求比较高。
生物信息学杂志不收版面费的比较少，就是Bioinformatics 也收。生物信息学在03年出来以后才快速发展的，期刊也是更晚才大量出现的，基本都是要先收费维持杂志的收支，然后过几年几十年之后，杂志名声出来了，数据比较多了，可以卖数据库收钱的时候，才可能免费。
这类没有自己生产的bench data的文章通常不太可能发布到最最顶尖的杂志，比如Nature或者Science的主刊。投文章时可以分为四个梯队：第一梯队：Nature Methods, 只要能发上面基本上就保证了关注度和引用，也会有很多人follow的；Genome Research, 很老牌的杂志了，文章的质量都很高，当然了editor大部分文章都是直接拒的。Nature Biotechnology,纯方法的文章很难发上来的，一般都是很大的组既有方法又有实验数据。楼主可参见Clinks和That那篇文章，很多个co-author，做了非常多的测序实验来验证。Nature Genetics，同样，很少有纯方法的文章，除非你在圈内已有很大影响力，比如CADD那篇文章。上面有一大堆做统计和GWAS的人，感觉不太欢迎machine learning的文章。第二梯队：Genome Biology, 比较新的杂志，近几年有一些不错的文章。Nature Communication, 非常新的杂志，基本上每期都会有一些生信类的文章。感觉影响因子在不断上涨，顶着Nature的头衔自然不会缺少好文章。审稿周期非常久，不建议需要短时间内发文章毕业的高年级博士。第三梯队：这一类别的杂志就很多了，Bio informatics曾经是最好的生信杂志，近几年因为文章数量太多灌水严重影响因子有所下降。Nucleic Acid Research也是专业的生信杂志。除了这些，Plod系列的Plod Genetics和Plod Computational Biology也都是接受生信文章的不错的杂志。Human Molecular Biology近几年也开始接受生信文章。第四梯队：如果被之前所有杂志都拒了，那基本上在国际上能够得到认可的杂志也就不多了。Explosion和BMC系列是最后选择了。
生物信息学领域的专门期刊:
Bioinformatics是作为生物信息学最重要的专门期刊了。
另外还有Briefings in Bioinformatics，这个杂志每年的发稿量少，最近几年IF波动很大，第一年24+，后来到9+
次一点的杂志，如BMC Bioinformatics，也是生物信息学的专刊。
对于计算向的生物信息学，PLOS Computational Biology是一个很好的期刊。
除此之外，Nature Method，也会有生物信息学相关的方法发表。
收的。
拓展资料：
纯生信是指不用做实验就可以发表的生信文章，生信文章是指生物信息学类的文章。
近年来越来越多的人对生物信息学感兴趣，因为它不需要任何实验就可以发 SCI，仅依靠生物信息的相关筛选和统计分析便可发文，一般纯生信或补充点相关实验大多是发1-5分文章。
喜欢收录纯生信文章的SCI期刊有：
Bioinformatics、BMC-Genomics、BMC-SYSTEMS BIOLOGY、Gene、Journal of Cellular and Molecular Medicine、Computational Biology and Chemistry等等。
生物信息学
是研究生物信息的采集、处理、存储、传播，分析和解释等各方面的学科，也是随着生命科学和计算机科学的迅猛发展，生命科学和计算机科学相结合形成的一门新学科。它通过综合利用生物学，计算机科学和信息技术而揭示大量而复杂的生物数据所赋有的生物学奥秘。
生物信息学是当今生命科学和自然科学的重大前沿领域之一，同时也是21世纪自然科学的核心领域之一。其研究重点主要体现在基因组学和蛋白质组学两方面，具体说就是从核酸和蛋白质序列出发，分析序列中表达的结构功能的生物信息。
