一、主体不同
1、SCI扩展版：是SCI的扩展库，也就是说SCI-E收录的期刊不一定算作真正的SCI成果。
2、SCI核心版：是由美国科学信息研究所（ISI）1961 年创办出版的引文数据库。
二、特点不同
1、SCI扩展版：SCI论文统计用检索系统改为用 SCIE。如果某位作者的论文被2000年版以后的SCIE收录，就算是被三大检索刊物之一的SCI收录了。
2、SCI核心版：通过统计大量的引文，然后得出某期刊某论文在某学科内的影响因子、被引频次、即时指数等量化指标来对期刊、论文等进行排行。
三、来源不同
1、SCI扩展版：是SCI的扩展库，收录了5600多种来源期刊，可通过国际联机或因特网进行检索。
2、SCI核心版：来源刊为3700多种的SCI印刷版和SCI光盘版。
参考资料来源：百度百科-SCIE
参考资料来源：百度百科-科学引文索引
SCI核心版只有3500种杂志，而扩展版，也称为SCI-E，也有3500种左右。区别在于： SCI核心版：上面的所有的文章均被SCI数据库收录，而且一般都是影响因子相对较高的杂志。 SCI-E：该杂志中只有部分文章被SCI数据库收录，而且多是一些低分杂志。
Science Citation Index Expanded是SCI的扩展版，SCI收录3000余种期刊,以前可以通过光盘或者手工翻阅可以检索。现在整合到Web of Science中，通过网络可以检索，期刊也增加到6000余种，所以称为Science Citation Index Expanded。 关于期刊的问题可以咨询《发表吧》他们比较了解。
SCI和SCIE（SCI Expanded）分别是科学引文索引及科学引文索引扩展版（即网络版），主要收录自然科学、工程技术领域最具影响力的重要期刊，前者收录期刊3600多种，后者收录期刊6000多种（包括2000多种外围刊），学科覆盖150多个领域。
在SCIE中的所谓的外围刊其实只是一个相对的概念，这些期刊也是ISI从全世界学术期刊中精选出来。因SCI的WEB版1997年才推出，在此之前国内各文献单位所订购的多为SCI的印刷版或光盘版，所以自然形成了以这两种版本所收录的3000余种期刊为基础的学术统计和评价体系，当SCI的WEB版出现后也就自然出现了核心刊和外围刊的区分。不过目前随着网络版的普及，外围刊的概念很快就不再存在了。在我国，经国家科学技术部有关部门和领导研究，决定从2000年的统计工作起，SCI论文统计用检索系统改为用 SCIE。也就是说：如果某位作者的论文被2000年版以后的SCIE收录，就算是被三大检索刊物之一的SCI收录了。
SCI从来源期刊数量划分为SCI和SCI-E。SCI指来源刊为3700多种的SCI印刷版和SCI光盘版（SCI Compact Disc Edition, 简称SCI CDE），SCI-E（SCI Expanded）是SCI的扩展库，收录了5600多种来源期刊，可通过国际联机或因特网进行检索。截止至2006年6月，耳鼻咽喉头颈外科领域SCI 期刊共收录30种，其中核心期刊（印刷版/光盘版）16种。被耳鼻喉科专业这30种SCI-E杂志收录都可以称作被SCI收录。可能通过直接进入SCI- E数据库检索来确定。如查某人第一作者发表的所有论文，可以直接用其姓名查找，遵照姓全称，名首字母缩写的原则，如韩德民则输入 han d m (姓和名，名和名之间有空格)。科学引文索引（SCI）收录期刊，可以点以下链接查询，Science Citation Index JOURNAL LIST（按字顺排） ；Science Citation Index SUBJECT CATEGORIES（按分类排）科学引文索引扩展版（SCI Expanded）收录期刊，可以点以下链接查询：Science Citation Index Expanded JOURNAL LIST（按字顺排） ；Science Citation Index Expanded SUBJECT CATEGORIES（按分类排）
SCIE杂志：
SCIE是汤姆森公司在原有的SCI文摘版源刊基础上精选了另外的部分杂志所形成的网络版。
SCI和SCIE的区别：SCI和SCIE（SCI Expanded）分别是科学引文索引及科学引文索引扩展版（即网络版），主要收录自然科学、工程技术领域最具影响力的重要期刊，前者收录期刊3600多种，后者收录期刊6000多种，学科覆盖150多个领域。查找SCI刊源有两个途径：①访问ISI公司网站：
SCI相当于EI核心，而SCIE相当于EI非核心。虽然你偶尔发现SCIE的影响因子可能比SCI还高，但就其影响价值仍不如SCI。ISI通过它严格的选刊标准和评估程序挑选刊源，而且每年略有增减，从而做到其收录的文献能全面覆盖全世界最重要、最有影响力的研究成果。办的比较好SCIE杂志可能成为SCI杂志，而办的较差的SCI杂志可能变为SCIE，甚至被SCI和SCIE所放弃。
