我是做环境微生物的,据我所知, 好的期刊有这一些 ISME>EM>AEM>FEMS MICROBIAL ECOLOGY=AMB .后两个稍微差一些,没那么多的名气. 不过EM的文章质量这两年有超过ISME的趋势, 影响力: JB=AEM>EM=ISME>FEMS seriers>AMB,其余非主流
呵呵，就个人的研究领域，关注点可能不一样。相对而言，在我所研究的领域，从1991年以来的EST中的相关文献每期都基本收集，认真阅读，再多看看其他杂志发表的一些文献，ACS本身的几个杂志中的文献，理论深度都要比EST要深一些。看一下，进行一下比较就大概了解了。 EST本身认可的文章，就是表征手段比较新，尽量贴近工程实践（EST不喜欢以模拟废水等进行实验所得出的数据），理论的深度提炼，不符合EST的录稿取向。 至于发表EST文章的事情，请到中国科学研生态中心去学习或者工作一段时间就知道了。表征手段及科研氛围都非常适合这里的学生、老师发顶级文章，亚洲唯一的EST编辑部在生态中心，我们都是把要发到EST的文章请EST编辑部的老师（很年轻）先看一看，录取率要高一些。仅水开放重点实验室2008年发表EST文章8篇（不含正在审稿的），生态的江老师是EST的编辑，他和他的学生就发的更多。 也没什么了不起的，只要努力，大家都一样。
applied and environmental microbiology杂志好像是周刊 or 半月刊之类的，美国微生物协会（ASM）主办的一杂志。这个杂志貌似 侧重于环境和生态等微生物 方面，而guodanni站友应该是检验科的，这就要看看他实验做的内容属于哪一块了；若是靠近病源微生物及耐药等方面，则这个杂志不合适。我曾经在这个杂志上发表过一短篇，感觉难度挺大的。 SCI杂志千万种，档次也各不相同；我是从事临床微生物的，这个领域主流杂志好像不是很多，知道的就是美国ASM主办的AAC，JCM；英国的JAC，这些都是4分往5分跑的；其他就是稍差一些了。今天手头刚好没有资料，不然就给多找几个杂志了。 另外，1分左右的微生物方面的SCI杂志很多，也很容易发表，楼主不妨自己google一下！
molecular ecology:太难了 要求非常高
1.文章引用率高 2.接收速度快，一个月左右就可返修，要是急着发的话这个杂志可以选择 3.微生物领域比较认可
该杂志很要求创新性 我投过两次。审稿时间大概都不到2个月，第一篇拒了，说没有新意，第二篇要求大修，而且改为短篇，这把我也改的够呛，我是拖了一个月才才开始改，在二个月的截止日搞到凌晨3点才投完，谁知第二天就接受了。总体感觉文章要有创新点，有别人没有发现过的东西，文章数据量的倒不是关键问题，我的第一篇数据量就很大，但也没有用。第一篇后来被JAM接受了，当然还是补了一点实验，补充的实验其实如果再投AEM可能也有戏，但是由于毕业的时间限制，所以不敢再投了。
9.4，杂志编辑和我联系：“We need more than 3 reviewers to make a final decision.”需要我再推荐1个以上的审稿人 9.13，我试着给杂志编辑发了一封邮件，咨询稿件处理的结果，9.14，编辑给出了决定：“The reviewer have recommended publication, but also suggest major revisions to your manuscript. Therefore, I invite you to respond to the reviewer' comments and revise your manuscript.” 三个审稿人给出的修改意见挺多的，其中一个从摘要到讨论，每个部分都提出了问题，幸好这些都不是太尖锐的问题，我根据他们的修改意见，一一进行了修改，并保留了一个具有修改标志的版本（这样可以看出我对文章的修改之处），然后给每个审稿人写了一封信，对每一个问题进行了回答。 9.26,通过杂志系统上传了最终的修改稿，并给编辑写了一封信，告诉他我已经按照审稿人的要求修改好了，并发送了具有修改标志的文章和给审稿人的信。 9.27，杂志编辑就给出了接受通知：“It is a pleasure to accept your manuscript entitled "xxxx" in its current form for publication in "Applied Microbiology and Biotechnology".”。
2014.07.07投稿Applied Microbiology and Biotechnology, 当天让修改内容，2014.07.15修改后重新上传 2014.07.16让修改内容 2014.07.18修改后重新上传，立刻变为with editor 2014.07.22, under review, 后时间又改为了08.05, 后时间又改为了08.11 2014.08.28审稿意见为大修，但是只有一个审稿人，而且，他的审稿意见说是大修，但其实他是想让补充一个实验，可实际上是根本不需要的一个实验，直接说明白就可以。整体来看小修都算不上。 2014.08.29将修改稿上传 2014.09.02另外一个审稿人的意见返回，应继续修改，属于小修 2014.09.03将稿件送语言公司进行修改 2014.09.11语言修回，重新将修改稿上传，很快退回,要求修改一些小格式 2014.09.12修改后将修改稿重新上传，当天with editor, 后来with editor的时间又改为了2014.09.13, 在2014.09.13的时间，状态变为decision in process, 在2014.09.15文章最终accept。 投稿中，投稿两三天的样子就修回了格式，一连修回了两次，效率很高，选的是Akira Kimura编辑，不晓得是不是送到她那里的，修回没两天就under review了，很开心！希望送审的编辑能够手下留情啊，马年马上发文章啊！上帝保佑！
AEM, JB,07年之后,他们的影响因子就从来没超过4分,所以没有掉到4以下之说. 之前我也很看重AEM,后来跟领域内小牛聊天,人家都是把最垃圾的论文丢到AEM. 他说5分以下的杂志,几乎每区别,可信度都不高. 后来投稿的时候,果断投AMB了,无他, AMB反应快,不收钱. 投AEM速度要慢,还收钱 .
Current Opinion in Microbiology 《微生物学新见》英国
ISSN: 1369-5274,
1998年创刊，全年6期，Elsevier Science出版社，SCI收录期刊，SCI
2005年影响因子8.005。著名微生物学权威专业性学术期刊，刊载本学科的研究成果、新进展评论、重要参考资料评注和文献题录。
Enzyme and
Microbial Technology《酶与微生物技术》美国
ISSN:0141-0229，1979年创刊，全年14期，Elsevier
Science出版社，SCI、EI收录期刊，SCI
2005年影响因子1.705，2005年EI收录227篇。刊载生物技术的基础与应用方面的研究论文、评论、专利和文献摘要。报道相关的经济、规章和法律信息。
Food Chemistry《食品化学》英国
ISSN:0308-8146，1976年创刊，全年16期，Elsevier
Science出版社，SCI收录期刊，SCI
2005年影响因子1.811。发表原始论文，内容包括食品化学分析，化学添加剂与毒素，与微生物、感觉、营养、生理有关的食品化学，食物加工与贮藏中分子结构的变化，农药对食品的影响，食品工程与技术的化学质量等。
Food Microbiology《食品微生物学》英国
ISSN:0740-0020，1983年创刊，全年6期，Elsevier
Science出版社，SCI收录期刊，SCI
2005年影响因子1.592。刊载食品微生物学方面的论文、评论、会议报告、简讯和书评，涉及食品中微生物检验的新方法、食品中微生物的发生学与生物化学、食品防腐剂、食品包装系统、食品损坏与安全、发酵食品、食品佐料和食品酶等。
International Journal of Food Microbiology《国际食品微生物学杂志》荷兰
ISSN:0168-1605，1984年创刊，全年24期，Elsevier Science出版社，SCI收录期刊，SCI
2005年影响因子2.499。国际微生物学会联合会和国际食品微生物学与卫生委员会机关刊物。刊载食品微生物学及相关领域的研究论文、快报、述评及书评，涉及食品微生物学和安全性、食品质量和可接受性，以及相关的细菌学、免疫学、真菌学、寄生虫学、病毒学等。
Journal of Bioscience and Bioengineering《生物学与生物工程杂志》荷兰
ISSN:1389-1723，1923年创刊，全年12期，Elsevier Science出版社，SCI、EI收录期刊，SCI
2005年影响因子0.948， 2005年EI收录211篇。1998年前刊名为Journal of Fermentation and
Bioengineering，原为日本发酵技术学会出版的《发酵学和生物工程杂志》。1999年该学会改名后，刊物随之改名。刊载生物科学与技术以及相关生物化学工程、食品技术和微生物学的基础与应用研究论文、札记、评论和文摘。
Journal of Fermentation and Bioengineering《发酵和生物工程杂志》荷兰
ISSN:1389-1723，1923年创刊，全年12期，Elsevier Science出版社，1998年后名为Journal of
Bioscience and
Bioengineering，原为日本发酵技术学会出版的《发酵学和生物工程杂志》。1999年该学会改名后，刊物随之改名。SCI、EI收录期刊，SCI
2005年影响因子0.948，2005年EI收录211篇。刊载生物科学与技术以及相关生物化学工程、食品技术和微生物学的基础与应用研究论文、札记、评论和文摘。
Journal of Microbiological Methods《微生物学方法杂志》荷兰
ISSN:0167-7012，1983年创刊，全年12期，Elsevier Science出版社，SCI收录期刊，SCI
2005年影响因子2.297。刊载微生物学研究与测定方法方面的研究论文和评论。内容涉及微生物的遗传学、生理学及新陈代谢，食品微生物学，生物技术，环境与应用生物学，工业微生物学，真菌学，原生动物学，藻类学，医学与兽医微生物学等（病毒学与免疫学除外）。
Microbes and Infection《微生物与感染》法国
ISSN:1286-4579，1999年创刊，全年15期，Elsevier
Science出版社，SCI收录期刊，SCI 2005年影响因子3.154。主要刊载分子和细胞生物学、微生物之间的相互作用主机(病毒、细菌、寄生虫、真菌;
还朊病毒)；当地感染的器官和组织的反应,包括本地及免疫病理；传染性疾病动物模型,包括防微生物非哺乳动物生物体；疫苗开发；临床和流行病学研究等方面的论文。
Microbial Pathogenesis《微生物病原学》英国
ISSN:0882-4010，1986年创刊，全年12期，Elsevier
Science出版社，SCI收录期刊，SCI
2005年影响因子2.303。发表人和动物传染病细胞与分子生物学方面的原始论文、评论和札记，涉及病原学、毒性因素、寄生感染与抵抗、免疫机理学、遗传学、病原体、原核膜机体、原生动物等。
Process Biochemistry《生化工艺》英国
ISSN:0032-9592，1966年创刊，全年12期，Elsevier
Science出版社，SCI收录期刊，SCI
2005年影响因子1.796。刊载微生物应用于工业、农业、食品、医药、能源、污染处理等方面的研究论文，报道新产品、新设备、新技术和国际会议的消息。
Research in Microbiology《微生物学研究》法国
ISSN:0923-2508，1886年创刊，全年10期，Elsevier
Science出版社，SCI收录期刊，SCI
2005年影响因子2.426。历史悠久的专业性学术期刊，刊载有关基础微生物学、生理学和微生物遗传学、生态学、应用微生物学、工业微生物学、细菌学和医学真菌学等微生物学领域的研究论文。不包括病毒学和免疫学方面的内容。
Toxicon《毒素》英国
ISSN:0041-0101，1962年创刊，全年12期，Elsevier
Science出版社，SCI收录期刊，SCI 2005年影响因子2.255。刊载动植物组织和微生物肌体衍生毒素方面的研究论文。
Trends in
Microbiology《微生物学趋势》英国
ISSN:0966-842X，1992年创刊，全年12期，Elsevier
Science出版社，SCI收录期刊，SCI
2005年影响因子6.648。刊载传染病毒研究的讨论、评论及进展新闻和书评，涉及细胞生物学、免疫学、病毒学生物技术和进化论等领域。
Veterinary
Microbiology《兽医微生物学》荷兰
ISSN:0378-1135，1976年创刊，全年28期，Elsevier
Science出版社，SCI收录期刊，SCI
2005年影响因子2.175。刊载家畜和家禽等动物微生物疾病的病源、病因、免疫、传染、预防、治疗、控制和药物应用等方面的研究论文、简讯和书评
仅仅是生态学方向的杂志还是太多了，您应该说的详细点，比如提供自己的研究方向，是哪一类的，比如是动物行为生态学？还是生理生态学？
一般影响因子不高的杂志，的确相对容易被接受。但是，这类杂志等待时间也很长，所以，要有提前的准备，否则影响毕业等结果就不好了。
给你推荐几个综合类的，比如ecoscience（影响因子1．0左右），plant species biology（1．3），community ecology（1．2），rangeland journal（1．0），new zealand journal of ecology（1．1），journal of natural history（1．0）
很少，也很困难。
推荐你参考以下期刊：
1.土壤学报
2.水土保持学报
3.土壤通报
4.植物营养与肥料学报
5.中国土壤与肥料
6.水土保持研究
7.中国生态农业学报
