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截至2014年3月，山东农业大学有1个农业部综合性重点实验室、2个农业部专业性重点实验室、2个农业部农业科学观测实验站、1个国家林业局山东泰山森林生态系统定位研究站，21个省级重点学科、13个省级重点实验室、1个省级人文社科研究基地、1个省级软科学研究基地，1个国家小麦改良分中心、1个农业部谷物品质检测中心、1个农业部农药环境毒性研究中心、1个黄淮海区域玉米技术创新中心、2个省级协同创新中心、12个省级工程技术研究中心、4个省级国际合作研究中心。 国家部委级科研机构机构名称主管部门依托学院负责人作物生物学国家重点实验室 科技部 生科院、农学院、园艺学院等 董树亭 土肥资源高效利用国家工程实验室 发改委 农学院、资环学院 温孚江 农业生产机械装备国家工程实验室科技部农学院、机电学院 国家苹果工程技术研究中心 科技部 园艺学院 束怀瑞院士 国家缓控释肥工程技术研究中心科技部农学院、资环学院 国家小麦改良中心泰安分中心 农业部 农学院 王洪刚 黄淮海区域玉米技术创新中心 农业部 农学院 董树亭 谷物品质监督检验测试中心 农业部 农学院 董树亭 作物生理生态与栽培重点开放实验室 农业部 农学院 于振文院士 园艺作物生物学重点开放实验室 农业部 园艺学院 王秀峰 作物生理生态与耕作综合性重点实验室 农业部 农学院 于振文院士 动物疫病病原生物学华东科学观测实验站 农业部 动科学院 泰山森林生态系统定位研究站 林业局 林学院 刘霞 创新战略联盟联盟名称依托单位理事长农业大数据产业技术创新战略联盟 中国测绘科学研究院、山东省科技厅、教育厅、农业厅、林业厅、国土资源厅、水利厅、省畜牧局、农机局，山东省农科院、山东农业大学、青岛农业大学，龙信数据（北京）有限公司、浪潮集团、山东金正大生态工程股份有限公司、山东登海种业股份有限公司 山东农业大学校长温孚江 全国农业装备产业技术创新战略联盟单位中国农科院、中国农业大学、山东农业大学、浙江大学、上海交通大学、吉林大学等 省级重点实验室机构名称主管部门依托学院负责人新农村建设土地资源空间数据采集与利用重点实验室国土资源厅 山东省小麦工程技术研究中心 科技厅 农学院 于振文院士，博导 山东省苹果工程技术研究中心 科技厅 园艺学院 束怀瑞院士，博导 山东省畜禽疫病防制工程技术研究中心 科技厅 动科学院 崔治中教授，博导 山东省农业环境污染控制工程技术研究中心 科技厅 资环学院 朱鲁生教授，博导 山东省农业生态环境工程技术研究中心 科技厅 农学院 李增嘉教授，博导 山东省粮食加工技术工程技术研究中心 科技厅 食品学院 董海洲教授，博导 山东省数字农业工程技术研究中心 科技厅 信息学院 梁勇教授，博导 山东省林业有害生物防控工程技术研究中心 科技厅 植保学院 孙绪艮教授，博导 山东省食品安全检测工程技术研究中心 科技厅 化学学院 周杰教授，博导 山东省城乡风景园林工程技术研究中心 科技厅 林学院 赵兰勇教授，博导 山东省村镇住宅工程技术研究中心 科技厅 水土学院 徐学东教授，博导 山东省中日设施园艺合作研究中心 科技厅 园艺学院 王秀峰教授，博导 山东省中德动物疫源性人兽共患病合作研究中心 科技厅 动科学院 柴同杰教授，博导 山东省农业微生物重点实验室 科技厅 植保学院 李多川教授，博导 山东省动物生物工程与疾病控制重点实验室 科技厅 动科学院 谭景和教授，博导 山东省土壤侵蚀与生态修复重点实验室科技厅林学院张光灿教授，博导山东省园艺机械与装备重点实验室科技厅机电学院李法德教授，博导山东省农药毒理与应用技术重点实验室教育厅植保学院王开运教授，博导山东省植物遗传工程重点实验室教育厅农学院于元杰教授，博导山东省作物高产生理重点实验室教育厅农学院于振文院士，博导山东省果树生物学重点实验室教育厅园艺学院杨洪强教授，博导山东省作物栽培与遗传改良重点实验室教育厅农学院王洪刚教授，博导山东省植物分子生物学重点实验室教育厅生科学院张宪省教授，博导山东省动物生殖与育种生物技术重点实验室教育厅动科学院谭景和教授，博导山东省土壤资源重点实验室教育厅资环学院张民教授，博导山东省作物生理生态重点实验室教育厅农学院王振林教授，博导山东省农村经济管理研究基地教育厅经管学院胡继连教授，博导山东省三农问题软科学研究基地科技厅经管学院胡继连教授，博导省级国际合作研究中心MIE技术中心 思达机械电子研究所等研究中心 烟草农业装备研究中心 现代农业装备工程技术研究中心 图书馆藏截至2014年3月，山东农业大学图书馆馆藏纸本图书233万册，期刊1600余种，电子图书257.6万种，电子期刊2.8万种，数字资源量77190GB。建立以生命科学和农业科学为优势和特色，覆盖其他相关学科的文献资源保障体系。 学术期刊《山东农业大学学报》（自然科学版、社会科学版），《山东畜牧兽医》等学术期刊，设有山东农业大学电子音像出版社。其中《山东农业大学学报》为首届全国优秀科技期刊，全国中文N/T类核心期刊，北大核心，国内外公开发行，农业综合性学术刊物。被国内外多家检索机构及文摘数据库列为来源期刊及统计源，如：《CSCI》、《中国学术期刊综合评价数据库》、《SCI》、《中国农业科技文献数据库》、《中国生物学文献数据库》、《中国林业科技文献数据库》、《中国农业文摘》等。美国国家农业图书馆、德国农业图书馆等20多个国外农业文献或研究机构均征订或收藏本刊。1992年，该刊被国家科委、中宣部、新闻出版署评为全国优秀科技期刊；1992、1995年两次获农业部全国高等农业院校优秀学报一等奖；1995年获全国高校自然科学学报二等奖；1996年被评为山东省优秀科技期刊；1997年被评为华东地区优秀期刊；1999年被评为泰安市十佳期刊；并于1996年加入《中国学术期刊（光盘版）》；1998年被中国科学引文数据库列为被引频次最高的中国科技期刊500家之一；1999年加入“中国期刊网”，同年加入“万方数据化资源系统数字化期刊群”。
