南京医科大学学报（社会科学版）已收入《高等学校文科学报文摘》和中国学术期刊（光盘版）全文检索系统。
南京医科大学学报(自然科学版)是北大核心（2019最新）南京医科大学学报(自然科学版)同时也是CSCD，也是科技核心月刊，影响因子0.58，主办是南京医科大学收录文章以本单位为主
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