1985年3月创刊，1999年改为月刊。本刊自创刊以来，及时报道了我国病理生理学领域的最新教学科研成果和国外病理生理学的新进展，促进了国内外学术交流。以办刊严谨、内容丰富、高质量的学术论文、较短的论文发表周期和优质服务深受广大作者和读者的厚爱。在国内医药科研机构、医学院校及医院等拥有很高的声誉。适合医药院校教学科研人员、研究生、广大临床医务工作者和高年级医学生阅读。
中国病理生理杂志是中国病理生理学会的会刊，中国病理生理学会（以下简称本学会）是中国病理生理科学工作者及相关单位自愿结成的、依法登记成立的全国性、学术性和科普性的法人社会团体，是中国科学技术协会（以下简称中国科协）的组成部分，是发展我国病理生理科学技术事业的重要社会力量，是党和政府联系我国病理生理科技工作者的纽带桥梁。
1992年、1996年、2000年、2004年和2008年连续五次入选中文核心期刊；并首批入选中国科技核心期刊。2000年在首届《中国学术期刊（光盘版）检索与评价数据规范》评优活动中本刊获《CAJ-CD规范》执行优秀奖，2002年荣获第三届中国科协优秀期刊三等奖。2004年—2008年，本刊发表的7篇论文连续五届荣获中国科协期刊百篇优秀学术论文奖。2008年和2009年本刊连续2次荣获“中国百种杰出学术期刊” 称号；2008年本刊在中文核心期刊基础医学类排名第一；并被评为“中国精品科技期刊”。 [到目前为止，《中国病理生理杂志》已被国内《中文科技期刊数据库》（科技部西南信息中心）、《中国期刊全文数据库》、《中文科技资料目录-医药卫生》、《中国核心期刊（遴选）数据库》（万方数据数字化期刊群全文上网）、《中国医学文摘》、《中国学术期刊文摘》等相关数据库及国际权威检索系统美国《化学文摘》、俄罗斯《文摘杂志》等收录，1999年进入中国期刊网。中国科学技术信息研究所信息分析研究中心检索报告显示，本刊作者和读者的地区分布广，分布数在26-30之间，作者单位包括北京大学医学部、协和医科大学、清华大学、复旦大学、中南大学、华中科技大学同济医学院、浙江大学医学院、中山大学等高等院校、全国各省市医院、科研院所以及美国、德国少数科研院所。2003年复旦大学、华中科技大学、中山大学、暨南大学等将《中国病理生理杂志》列为国内权威期刊。
