侧重领域各有不同吧。
按期刊质量来说，《光学学报》是EI，《红外与毫米波学报》是SCI，后者更好一些。
上海交大2013年12月3日查询结果：
光学类期刊2013年SCIE收录的有两本，为Chinese Optics Letters 和 光谱学与光谱分析，但由于光谱学与光谱分析的自引率过高，被警告，所以近几年并没有IF，但还是有两本的。
EI期刊的话2013年收录的共有10本，1、Chinese Optics Letters 2、Optoelectronics Letters 3、发光学报 4、光谱学与光谱分析 5、光学精密工程 6、光学学报 7、光电子.激光 8、红外与激光工程 9、强激光与粒子束 10、中国激光
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光学学报，光电工程，光学精密工程Optic letters ，Applied optics ，Optical engineering还有IEEE的有一个 这些看得比较多，其他的不是很了解
