在免疫学方面的文献中,流式图是标配,现在总结一下文章中流式图的排版。
第一个案例[1]:
不同样本不同时间点的流式图,这是放在正文中的流式图,排列如下所示:
此图特点:①所有样本的中使用的相同marker,都使用一个,放在一个大坐标中,坐标并没有使用流式细胞仪自带的软件或者是Flowjo标记的标签,图是经过了AI或PS编辑;②上端是时间标签;③右端是样本标签;④左端与下端是markers标签;⑤。
第二个案例[2]:
在这个图中,使用了不同的门亚划分亚类,使用箭头来标明亚群的流式图,如下所示:
此图特点:①细胞的marker,也就是横纵坐标轴没有使用流式细胞仪自带的软件或Flowjo进行编辑,图是经过了PS或AI的编辑;②如果B亚群在A亚群里面,使用箭头进行标记。
如果是单染的话,通常是使用峰图来表示,还是此篇文献,如下所示:
此图特点:①单染通常使用峰图表示,使用不同的颜色来标记不同的样本。
第三个案例[3]:
在这个案例中,有四组,其中一组是对照,剩下三组用同一个因素去干预,可以使用横线来表示,如下所示:
此图特点:①对照组放左图,实验组放右边;②实验组使用相同的条件进行干预,要使用横线进行标明;③相同的markers可以统一使用,不同在每张流式中进行标明,而是使用AI或PS进行统一编辑。
第四个案例[4]:
此图特点:①某个亚群的亚群,使用箭头来标明;②不同的样本来源,在每张图式图的上面进行标注;③右边的两张图是使用了同型对照;④通常情况下,首选使用FSC/SSC来划分亚群,不过有的情况下,也有人直接放出目标细胞的亚群,看下面的案例。
第五个案例[5]:
此图特点:①并没有使用FSC/SSC来进行第一个亚群的划分,原因我猜可能是由于排版的问题,直接放出最关键的亚群即可。②小图的右边是对每个亚群进行定量。
现在总结如下:
一、在进行不同的亚群划分时,通常是先SSC/FSC进行画门,严格情况下,有人还会使用DAPI来区分死细胞,然后再在该门中进行目标细胞亚群的划分。
二、从流式细胞仪中直接拷出来的流式图,或者是经Flowjo编辑过的流式图通常无法直接放在文章中,需要放在AI或PS中进行进一步的编辑与排版,例如每个样本的流式图不必都标记上marker,把相同的marker直接使用一个大的坐标系,每张流式图的上方或右侧放上样本名称。
三、如果样本多,需要进行统计时,还要放上统计结果。
四、在进行流式图的排版时,不同的markers直接写上就行,荧光染料通常不用标记,例如在使用F4/80-PE对细胞进行染色时,最终坐标上只用写上F4/80即可,不用写上F4/80-PE。
流式的图一般是两种形式。一是柱状图,X轴是信号强度,Y轴是计数。数据通常显示为峰值。比如阴性或者信号弱的峰在左侧,而阳性或者信号强的就位于右侧。柱状图一次只能显示一个通道信号,通常用来判断阳性,阴性的区别或者单个通道信号在不同样本间的变化。另外一种形式是散点图。就是把两个通道的信号同时显示在图上。优点是由于同时显示两个通道的信号,可以提供比柱状图更多的信息。多色流式样本检测一般都是通过上下级关系的图来显示不同的图。比如在上一级的图中先针对某个细胞群画了个门,然后该门内所有细胞又可以用其他通道的信号显示到另外一个图上进行进一步的分析。
从左到右,从上到下,第一个图横轴是FSC,纵轴是SSC,一个前向角,一个侧向角,具体定义就不说了,这两个指标主要用于判断细胞的大小。利用这个图可以去除细胞碎片以及粘连在一起的细胞,只挑单个细胞进行后续分析。
你可以继续问。
流式的图千差万别。一般是散点图和柱状图两种形式。
散点图看的是两个指标的相对关系,而柱状图看的是一个指标。数值越大的,说明该指标的荧光强度越大。
再具体的,就要根据具体的图来说了。你把结果贴一下看看。