两者都不错。不过微生物学更侧重于理论生物及实验室设计，分子植物遗传育种是侧重于理论与实践相结合，可能要去农间地头，因此是两者都不错。《微生物学报》创刊于1953年，是由中国科学院微生物研究所、中国微生物学会主办的以微生物学基础研究和应用基础研究以及高技术创新为主的综合性学术刊物。
根据主管单位级别期刊等级，基本全是国家级：
1.《生态学报》国家级，主管：中国科学技术协会
2.《生物化学与生物物理学报（英文）》国家级，主管：中国科学院
3.《遗传学报(英文版)》国家级，主管：中国科学院
4.《中国生物化学与分子生物学报》国家级别，主管：中国科学技术协会
5.《生物化学与生物物理进展》国家级，主管：中国科学院
6.《微生物学报》国家级，主管：中国科学院
7.《生物物理学报》国家级别，主管：中国科学技术协会
8.《遗传》国家级，主管：中国科学院
9.《生物工程学报》国家级，主管：中国科学院
10.《应用生态学报》国家级，主管：中国科学院
11.《中国科学院》国家级，主管：中国科学院
12.《中国科学.C辑》国家级，主管：中国科学院
13.《古生物学报》国家级，主管：中国科学院
14.《微生物学通报》国家级，主管：中国科学院
15.《水生生物学报》国家级，主管：中国科学院出版图书情报委员会
16.《菌物系统（改名为：菌物学报）》国家级，主管：中国科学院
17.《生物多样性》国家级，主管：中国科学院
18.《生物工程进展（改名为：中国生物工程杂志）》国家级，主管：中国科学院
19.《实验生物学报》新闻出版总署未查到，应该属于停刊或改名期刊
20.《生命的化学》国家级别，主管：中国科学技术协会
21.《古脊椎动物学报》国家级，主管：中国科学院
22.《微体古生物学报》国家级，主管：中国科学院
23.《生态学杂志》国家级别，主管：中国科学技术协会
24.《生物数学学报》新闻出版总署未查到，应该属于停刊或改名期刊
我建议您这样比。水生生物学报PK微生物学报。二者侧重不同。但都是中科院的。微生物学报是中科院微生物所主办。水生生物学报是中科院水生所主办的。水生生物学是侧重水体浮游动物浮游植物以及大型鱼类的研究，可以这么说吧，主要是研究淡水微生物。微生物学报则研究主要是不限于水体的微生物。
至于微生物学通报您可以拿去跟植物学通报什么的比比，更科普一些。仅供参考。
<<生物学通报>>只有封面是彩图的，内页是正常黑白印刷。要看带彩图的生物期刊，一般都是科普类，不是学术期刊。如《人与自然》、《科学世界》、《科学通报》等。
