《微生物学杂志》为中国科技论文统计源期刊、中国科技论文核心期刊、生物学核心期刊，先后被美国《化学文摘》（CA）、《英联邦农业文摘》(CAB) 、日本《科学技术文献速报》(CBST)、《CNKI期刊全文数据库》、中国科学引文数据库(CSCD) 、《中国生物学文摘》、《中国核心期刊（遴选）数据库》、《万方数据—数字化期刊群上网期刊》、《中国学术期刊综合评价数据库》、《中国期刊全文数据库》、《中文科技期刊数据库》等国内外重要检索刊物摘引和收录。
1、生态学报
2、应用生态学报
3、生物多样性
4、生物工程学报
5、遗传
6、生物化学与生物物理进展
7、微生物学报
8、中国生物化学与分子生物学报
9、水生生物学报
10、中国生物工程杂志
11、中国科学.C 辑，生命科学
12、生态学杂志
13、微生物学通报
14、应用与环境生物学报
15、生物物理学报
16、古脊椎动物学报
17、古生物学报
18、微体古生物学报
19、生物数学学报
20、生物技术
21、生命的化学
22、实验生物学报（改名为：分子细胞生物学报）
23、生物技术通报
24、生命科学
25、生物学通报
国内生物类期刊中，排在第一的《Cell Research》杂志已经成为了本领域较为有影响力的期刊，不少著名学者都选择将新成果发表在该期刊上，其影响因子自突破10之后，今年又稳步上升至了12.413，这份期刊于1990年创刊，2001年首次获得影响因子，这份杂志由中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所与中国细胞生物学学会共同主办。 同时，中科院的另外一份期刊：MOL PLANT(分子植物) 也升至6.337，排在第三，据报道这两份期刊SCI影响因子位于同学科前10%，另外中科院还有《国家科学评论》《中国病毒学》今年上半年被SCI正式收录。
MOL PLANT(分子植物)创刊于2008年，由中国科学院主管，中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所和中国植物生理与分子生物学学会共同主办，中国科学院上海生命科学信息中心承办。目前这份期刊在植物科学领域期刊中已位列亚洲第一，在全球植物生物学领域研究类期刊排名也很靠前，前面的几份期刊是Plant Cell, Plant Physiology, New Phytologist等，可见这一期刊已跻身国际植物学领域顶级期刊行列。
还有遗传学报(J GENET GENOMICS)也是发展迅猛，影响因子从去年的2.924上升至3.585，这份期刊由中国遗传学会，中国科学院遗传与发育生物学研究所主办，主要刊载动物、植物、医学和微生物等遗传学领域的研究论文，也包括该领域中的最新技术和最新方法。大
