这两个学报都是经批准的正规学术期刊。如果想发表水电、电气、机械、工程管理、医学等方面的论文建议选三峡大学学报；如果想发表石油、勘察、农学方面的论文建议选长江大学学报。
不好比较。希望我的分析能对你有用，或者说你的提问也不是特别恰当。
1.如果论权威。自然《消费导刊》不在话下，原名《中国轻工业经济》，1950年创刊，可算得上中国老字号期刊，原主办单位中国轻工部主办，改制后依次是中国轻工局，目前是中国轻工业联合会主办，仍旧是国家级期刊，1992年，1996年入选《中文核心期刊要目总览》。从曾经的学术影响力到如今的市场与学术并行，发行量，号召力以及阅读体验；在轻工经济研究、消费者行为学研究方面，也是行内领先期刊。这些方面三峡大学学报(自然科学版)，三峡大学学报(人文社会科学版)，与之相比，几乎没有任何可比性。
三峡大学学主办单位三峡大学，其级别也仅仅是省级期刊，从创办至今，并无获得任何荣誉，到如今省级且是院校学报订阅者并没有几人。根本谈不上权威。
综上述，两者相较，没有可比性。
2.前提：你是学生。对你而言哪个对你有利，就问你所为何“利”，评奖学金还是毕业，还是所为什么。
《消费导刊》，主为轻工领域，消费领域名家，以及工业经济学科内科研人士，企业管理者作者。作为学报面对的作者群体以及作者群体大部分为高校师生。所以前者是外在影响，后者是内在影响。建议你可以投《三峡大学学报》，不过在下看来，如果不是比较有影响力的学报，学报实在是没有多大的意义了。
三峡大学学报投稿相对于北大核心来说，不是那么难的。
《三峡大学学报》（自然科学版）（原名《武汉水利电力大学（宜昌）学报》）（双月刊）创办于1979年10月，是三峡大学主办的以水电工程技术为主的学术刊物。
立足三峡，面向全国，探索创新，注重理论联系实际，择优登载水利水电工程、建筑工程、机械工程、电气工程、管理工程以及基础科学等方面的文章。
自1998年第1期起入编《中国学术期刊（光盘版）》，1999年（用刊为1998年）被列入国家科技部中国科技论文统计源期刊，是俄罗斯《文摘杂志》源刊。.主要栏目：水电论坛、土木工程、机电工程、信息技术、化学与生命科学、数理研究。
