外科系统：麻醉科 头颈外科 泌尿外科 胃肠外科 妇瘤科 乳腺科 胸外科 肝胆外科 骨与软组织肿瘤科内科系统：放疗科 中西医结合科 血液科 呼吸内科 消化内科 门(急)诊部科研系统：医学情报研究所 肿瘤流行病研究中心 药物研究所 分析实验中心 分子生物学研究中心 《甘肃医药》编辑部 药理毒理实验研究中心 医学生物技术研究中心医技系统：放射科 检验科 核医学科 病理诊断中心 功能科 药学部行政系统：院长办公室 党办 人事科 财务科 工会 科教科 医务科 护理部 后勤保障科 基建办 网络中心 审计科 感染管理办公室 公共卫生科
医院现有省肿瘤研究所、省医学情报所（卫生部医药卫生科技项目查新咨询单位）、《甘肃医药》编辑部、省肿瘤防办、省抗癌协会、省健康相关产品毒理检验机构、省止痛中心、省乳腺病诊治中心、省放射治疗研究中心、爱德甘肃流动医院、卫生专业考试甘肃考区兰州（西）考点办等省级机构。有医学生物技术中心、分析实验中心、药物研究所、实验动物中心等科研机构，其中内设的分子生物学实验室、中药分析实验室及中药药理实验室为国家中医药三级实验室,中药制剂和中药毒理室为国家中医药二级实验室。设有病床300张，临床、科研、医技和职能科室40余个。全院429人，其中专业人员352人，正高级12人，副高级54人。国务院特贴专家2人，人事部333人才2人，省级专家2人，省卫生厅中青年学术技术带头人12人，硕士7人，博士1人，院聘首席专家4人。
心电与循环
健康教育与健康促进
浙江医学教育
天津中医药大学学报
江西中医学院学报
现代电生理学杂志
中国微循环
中国骨科临床与基础研究杂志
卫生经济研究
医院院长论坛
长治医学院学报
承德医学院学报
滨州医学院学报
济宁医学院学报
川北医学院学报
沈阳医学院学报
吉林医药学院学报
《南通大学学报》（医学版）
江汉大学学报（自然科学版）
暨南大学学报(自然科学与医学版)
延边大学医学学报
汕头大学医学院学报
健康研究
内科
泸州医学院学报
神经药理学报
泰山医学院学报
牡丹江医学院学报
右江民族医学院学报
潍坊医学院学报
齐齐哈尔医学院学报
辽宁医学院学报
河北联合大学学报（医学版）
安徽卫生职业技术学院学报
九江学院学报（自然科学版）
赣南医学院学报
黔南民族医专学报
延安大学学报（医学版）
山东医学高等专科学校学报
菏泽医学专科学校学报
求医问药
药物评价研究
北方药学
基础医学教育
生物医学研究杂志（英文版）
中草药(英文版)
广东医学院学报
中药与临床
中外医学研究
骨科
咸宁学院学报(医学版)
湖北民族学院学报医学版
中外妇儿健康
中南医学科学杂志
湘南学院学报(医学版)
湖南师范大学学报(医学版)
肿瘤药学
河南职工医学院学报
河南大学学报医学版
河南科技大学学报医学版
西北医学教育
国际眼科杂志英文
陕西中医学院学报
延安大学学报医学版
兵团医学
药品评价
西北药学杂志
天津药学
上海医药
临床药物治疗杂志
今日药学
海峡药学
国际医学放射学杂志
四川精神卫生
神经病学与神经康复学杂志
实用肿瘤学杂志
浙江创伤外科
实用手外科杂志
岭南现代临床外科
抗感染药学
局解手术学杂志
河南外科学杂志
国际骨科学杂志
中华临床免疫和变态反应杂志
心脑血管病防治
江苏实用心电学杂志
实用糖尿病杂志
寄生虫病与感染性疾病
国际心血管病杂志
国际消化病杂志
疾病预防控制通报
岭南心血管病杂志英文版
医学检验与临床
现代诊断与治疗
透析与人工器官
天津护理
实用疼痛学杂志
实用临床医学
实验与检验医学
上海医学影像
蛇志
岭南急诊医学杂志
临床医学
临床护理杂志
当代护士
四川生理科学杂志
四川解剖学杂志
数理医药学杂志
江苏卫生保健
安全与健康
中医药文化
中医研究
中医文献杂志
中国民族民间医药
浙江中医杂志
浙江中西医结合杂志
云南中医中药杂志
新疆中医药
现代中医药
四川中医
实用中医药杂志
甘肃医药
中医儿科杂志
实用中西医结合临床
实用中医内科杂志
深圳中西医结合杂志
上海针灸杂志
高原医学杂志
内蒙古中医药
陕西中医
江西中医药
湖南中医杂志
湖北中医杂志
黑龙江中医药
河南中医
国医论坛
广西中医药
西部中医药
甘肃中医学院学报
职业卫生与应急救援
职业卫生与病伤
浙江预防医学
医学动物防制
现代医院
现代医用影像学
微量元素与健康研究
上海预防医学
江苏预防医学
口岸卫生控制
江苏卫生事业管理
工企医刊
浙江实用医学
云南医药
右江医学
医学研究与教育
医学信息
医学新知
医学理论与实践
现代医药卫生
现代实用医学
现代临床医学
西南军医
西藏医药
微创医学
首都医药
实用医药杂志
青海医药杂志
青岛医药卫生
齐鲁药事
农垦医学
宁夏医学杂志
内蒙古医学杂志
江西医药
交通医学
吉林医学
淮海医药
华夏医学
解放军医药杂志
黑龙江医药科学
黑龙江医药
黑龙江医学
河南医学研究
河北医学
哈尔滨医药
贵州医药
广州医药
广西医学
食品与药品
心理学探新
心理与行为研究
山东医药
基层医学论坛
全科护理
临床医药实践
山西中医
山西中医学院学报
实用医技杂志
实用医学影像杂志
中医外治杂志
福建中医药
福建中医药大学学报
东方食疗与保健
按摩与康复医学
河南预防医学杂志
应用预防医学
广东微量元素科学
安徽预防医学杂志
首都公共卫生
疾病监测与控制
包头医学
安徽医学
中国医院院长
中日友好医院学报
遵义医学院学报
山东大学耳鼻喉眼学报
口腔医学
口腔颌面外科杂志
口腔材料器械杂志
广东牙病防治
北京口腔医学
口腔生物医学
肝博士
生物医学工程学进展
《甘肃医药》在国家新闻出版总署上能查询到，是正规期刊，知网收录，是医学综合类科技期刊。
评职能否承认要以单位的要求为准，符合要求发表就没问题。
