需要注意的是：这里所讲的日文文献是广义上利用日本网上资源所搜索到的文献资料，其内容可能是日文或者英文，也可能并非在日本出版。另外，以下的文献资源应当都是适于引用的。
科技类：
（1）JST系
一般讲到日本的文献收录索引大家都知道科学技术文献速报（简称"文速"）。文速是由独立行政法人科学技术振兴机构（JST）所发行的文献索引，跟SCI/EI差不多但却是以实体形式出版的半月刊（生命科学类是每旬出版）；每年有6次（生科12次）以光盘出版，有料而且不提供在线检索，我国有一些图书馆可能有购买。因为上面登录的主要还是英文资料，学校没有必要专门去买，一般对我们没有什么意义。JST也提供、整合在线服务，虽然有用的都是有料的，但也有一些不错的无料资源。
以及
日本科技门户。如果你一个网址也不想记的话就记这个吧，基本上后述的资源都可以在上面找到。该站提供科技新闻、学术会议通知和日程、研究者访谈、recruit、program、statistics、white paper等等。一些特色资源：JST出版的在线期刊科技产业新闻期刊JST New（ 无料全文）、情报管理（ Journal of Infomation Processing & Management 无料全文）、产学官连携（ Journal of Industry-Academia-Government Collaboration 无料全文）
在首页左下的链接中整理了一些机构的网上出刊：（）其中比较值得看的是理研发行的两份，都无料（后者需注册）。
左下即可链到Science Links Japan（）有中英日三语，提供的资源实在是太多了，具体内容请自行浏览。如果这里还不能满足你，就不需要再找日文资源了，直接找欧美的文献资料吧。
一个有意思的Facts DB：失败知识データベース 日本人真是太有心了……
在Science Portal上面最有价值的资源在右边データバンク栏里面，
文献データベース
书籍データベース
特许データベース
这些是专门数据库的整理和索引，应当够用了。需要注意的是有的数据库并非无料。
无料全文数据库：
非常著名的OA数据库，主要收录学会、研究报告、摘要等。前面那位问的JSME的会志也收录在内。
Yet another，以过刊为主，但可以检索J-Stage的资料。
专利文献等：
J-STORE 可以下载研究课题、报告、公开特许的全文
ACT-JST 计算科学应用专门，可以下载研究课题、报告、公开特许的全文
参考资源：
日本化学物质辞书Web
有机化合物のスペクトルデータベース SDBS
（2）NII系：
日本除了JST之外，还有一个做情报学研究及相关服务的专门机构，就是国立情报学研究所（National Institute of Informatics ）。提供以下特色服务：
CiNii（NII论文情报ナビゲータ）
最有用的，查文献就靠它。提供abstract、reference、citing，有的文献（而且不是少数）提供无料全文--虽然首页上说是有料利用……
Webcat Plus
英文版
馆藏图书、杂志搜索引擎，特点是支持联想和自然语言处理（NLP）。只是让你知道到哪里去借，没有收录全文；能够搜索图书、杂志的馆藏情况以及某些书籍的简单内容介绍、评论，对于某些keyword可以精确定位到页码。
学协会情报発信サービス
如果你知道你要的文献在是那个学会出版，那么最好直接去这个协会的主页看看有没有提供文献的检索和下载。这是NII的学会索引。
JuNii 大学Webサイト资源検索
可以搜索一些大学网站上提供的资源，很多都是有全文的。运气好的话某个研究室正好跟你研究方向match，在自己的主页上又提供文献下载……（注：这个在查找学位论文方面是非常有用的。）
参考资源：
Sciterm（オンライン学术用语集）
可跨学科搜索文部科学省刊行的《学术用语集》中的用语。
以上的资源对于理系而又有特殊需要的人来说应该已经够用了。由于我自己是学生物的，所以是完全用不到日文文献的。只提供一个好玩的：
Jabion
这个网页可以用日文keword来搜索PubMed~~~~~~~~:)
下面主要是人文社科类：
历史、政治、法律等：
国立国会図书馆
提供国会会议记录、法令、年报、图片、历史记录，资料很丰富，在这里还教你怎样针对研究课题查找资料。另外还有贵重文物（文化财）、近代图书的图片数据库。这些全部是无料的！
东京大学史料编纂所
强力推荐。日本史研究必备，有用又好玩。
文学相关：
青空文库
全文收录，无料利用；文学首选。一般著作权自然丧失（作者死后50年）的日本文学作品在这里都找得到。如果你要的在这里找不到的话，网上有的可能性就比较小了。
日本文学电子図书馆
好像有一些青空文库没有的资料。
书籍デジタル化委员会电子図书馆 The Library on the Web
严格来说这是个整合索引站，它上面的资料基本是整理转链其他站的。里面有一些有意思的东西，比如日本人翻译的欧美作品。似乎04年3月以后基本没有更新。不过上面有整给出来源网站，可以搜寻利用。
出版文化研究会 Internet Virtual Library : Intel-Wing
非常大的分类索引，提供许多人文社科和自然科学数据库以及专门站的连接，强烈推荐。
他:
日本文学関系テキストファイル等
日本文学等テキストファイル
一些零星的资料
另外的查文献方法（泛用性较差）：
需要日本大学里有认识的人，然后让对方把自己的图书馆帐号或者ezProxy之类的借出，一些有料的资源就可以使用了，当然前提是对方大学有这个权限。这个方法不仅对日文文献，英文文献也同样适用……
以上。
请充分地利用这些资源（小日本的东西不用白不用）。希望有人进一步发掘出好用的资源，当然，要是无料的~~
日本学刊期刊影响因子为：1.25。
日本学刊杂志 国内刊号为：11-2747/D， 目前被CSSCI 南大期刊(含扩展版)、万方收录(中)、知网收录(中)、国家图书馆馆藏、维普收录(中)、上海图书馆馆藏、等收录， 获得过中国优秀期刊遴选数据库、中国期刊全文数据库（CJFD）、中国人文社科学报优秀期刊、等荣誉。
ssci收录的日本期刊有《日本研究杂志》。
SCI选择期刊比较科学，它运用引文数据分析和同行评估相结合的方法，充分考虑了期刊的学术价值，在选用的数千余种期刊里包含了国际上较为重要的期刊。
它所择取的80万条论文，可以说是集各学科之精萃。因而，它成为国际公认的反映基础学科研究水准的代表性工具。
