遵循科学技术面向经济建设的宗旨，刊物以报道基础和应用基础研究成果为主，高度重视报道有影响的重要技术研发成果。刊物内容涉及水圈范围内的生物学、物理学、化学、地质学等学科及其分支学科，形式有论文、研究简报、高新技术、高水平综述、学术争鸣等。《海洋与湖沼》杂志自创刊以来，该刊在培养人才和促进国内外学术交流等方面做出了重要贡献。尽管本刊是中文期刊，但在国际上具有较重要的学术影响，现与世界上建立交换关系的国家有德国、日本、英国、苏格兰、荷兰、丹麦、菲律宾、俄罗斯、法国、澳大利亚、美国、墨西哥、印度、比利时、挪威、加拿大等，以及中国的台湾、香港地区的总共51个机构；国内发行交换范围包括34个省市地区的高校和科研单位及图书馆。
1 本刊以报道基础和应用基础研究成果为主，重点刊载有影响的重要技术研发成果论文。内容主要涉及江河湖海、沼泽湿地等方面的高端科技论文，学科涵盖生物、物理、化学、地质等多个学科及其分支，形式有研究论文、研究简报、高新技术、高水平综述、学术争鸣等。2 来稿要求语言通顺，逻辑严密，论点明确，数据可靠。每篇论文必须附有中、英文提要和中、英文图表题。提要要求简洁明了，其内容要“拥有与论文同等量的主要信息”；英文图表题与中文图表题的信息量要保持一致。3 本刊对所有投稿在初审前和发表之前都将要接受至少2次科技期刊学术不端文献检测系统AMLC的检查，以阻止任何可能的学术剽窃或科学不端行为，如抄袭与剽窃、伪造、篡改、不当署名、一稿多投等行为。被证实的抄袭（包括自抄）造假稿件或一稿多投将会被直接退稿并列入黑名单。4 每篇论文应按《中国图书馆图书分类法》（第4或5版）确定本文的专业分类号。5 项目来源、基金号、通讯作者E-mail地址等信息请置入论文首页脚注。6 本刊特别欢迎中外合作或来自国外资助项目的高端论文。7 文中的量和单位要使用中华人民共和国法定计量单位，外文字母符号的大、小写，正、斜体，黑、白体要清晰。8 语言文字和科技名词的使用应该符合国家有关规范和术语标准。具体内容请访问全国科学技术名词审定委员会和国家语言文字工作委员会网站。9 凡涉及国界和领土权益的地图，均须以中国地图出版社最新出版的地图作为本图件的底图。10 参考文献排列顺序为先中文后英文，中文文献按笔划顺序排列； 英文文献按字母顺序列。详细投稿格式请参阅我刊主页“常用下载”栏下载格式模版文件。11 稿件文责自负。凡编辑部对稿件所做的实质内容的修改须经作者同意。12 本刊现已采用在线投稿，请登录我刊网站，第一次登录请点击“作者”—“注册”—“登录”。登录后按照提示投稿，请提供Word版本稿件。投稿时请推荐4-5个审稿人，提供其专业特长、姓名、职称及地址、电子信箱等通讯方式。稿件收到后即通知作者。审稿优秀者优先刊用。13 投稿时请在系统提交版权页的扫描文件（在我刊主页“常用下载”栏下载，填写扫描后作为附件上传，并命名为xxx-HYHZ论文著作权转让书）； 请提供所有作者的详细信息（姓名，工作单位，电话，email，身份证号等）。14 图件要求:(1) 投稿时请一并上传文中所有插图的原始格式的图文件。所谓原始格式，即该图件首次生成时所用软件的内置默认格式，请勿转换格式。请尽量提供矢量图。建议的格式如eps、emf、xls、cdr、psd等，尽量不要使用jpg、bmp格式。如确实无法提供矢量图，请“另存为”或“导出”原始位图（tiff格式），文字图层不要栅格化并合并到图层；在设定图件的长宽大小后，设定分辨率至少600dpi。可用普通打印机打印出图片判断是否合乎出版要求，也可以在电脑上放大500倍后观察；如出现模糊、毛边、像素点等现象，图片质量不合格。图中线条粗细至少要求0.5磅以上，不大于1.5磅，以便在pdf文档或互联网上能清楚显示。(2) 插图要求线条圆滑；图中的文字数字尽量少，不能重叠； 地名、数据等要与文中出现的一致。欢迎提交彩色图件。黑白照片要求反差明显、内容清晰。(3) 所有图做好后请直接插入主文件Word文档中，版式请用嵌入型，并同时将所有图件一起打包压缩（zip或rar格式）上传。
研究所在为国民经济服务方面，开展了海洋经济动植物的生物学和人工养殖原理研究，先后进行了海带、紫菜、中国对虾、贻贝、海湾扇贝等人工养殖原理和方法的研究，做出了许多开创性和奠基性的工作。据2015年10月研究所官网显示，海洋所共取得900余项科研成果，其中国家一等奖6项，国家二等奖24项，全国科学大会奖15项，山东省科技最高奖3项，中科院和省部委重大成果奖、科技一等奖127项，国际奖16项。共发表论文9400余篇（其中SCI/EI收录论文2600余篇），出版专著210余部；共获国际发明专利授权7件，国家发明专利授权270余件，实用新型专利授权140余件，外观设计专利50余件。 《海洋科学》是由中国科学院主管、中国科学院海洋研究所主办的学术性期刊， 1977年创刊。及时报道海洋学及其分支学科的新成果、新理论、新观点、新工艺和新进展。尤其对重大科研和应用研究成果特别予以优先报道。主要刊登海洋生物、海洋水产生产、海洋活性物质提取、海洋环境保护、海洋物理、物理海洋、海洋地质、海洋化学、海洋工程、海洋仪器研制等方面的文章。《海洋科学》 是 中国自然科学核心期刊、华东地区优秀期刊、中国科学院获奖期刊、山东省优秀期刊。该刊已被中国国外数据库如美国的《化学文摘》（ CA）、英国的《剑桥科学文摘》和联合国的《水科学和渔业文摘》（ASFA）收录；被中国的《中国期刊全文数据库》、《中国学术期刊综合评价数据库》、《中文科技期刊数据库》、《中国海洋文献数据库》等十几个数据库收录。《中国海洋湖沼学报》（英文版）是由中国海洋湖沼学会主办、中国科学院海洋研究所承办的一级学报类学术期刊，1982年创刊。该刊主要刊登内容为海洋湖沼科学及相关的生物、水产养殖、物理、气象、化学、地质、水文、地貌、工程、环保、遥感、仪器等方面的国内外最新研究成果，包括论文，简报，综述等。该刊已被SCI-E、CA、AJ、BA、OA、ASFA、BIOSIS、CBA、南非NISCSA、中国期刊全文数据库(CJFC)、中国学术期刊文摘、海洋文献数据库、中国生物学文献数据库、中国科学引文数据库,中国核心期刊数据库、中文科技期刊数据库、中国科技论文统计源期刊，以及中国台湾CEPS等文摘杂志及数据库收录。《海洋与湖沼》学报是中国海洋湖沼学会主办的、中国海洋湖沼科技领域最有影响的基础性综合学术刊物之一。该刊创办于1957年，中国科学院海洋研究所相建海所长担任主编。刊物以报道基础和应用基础研究成果为主，特别重视刊载有影响的重要技术研发成果的论文。刊物内容涉及水圈范围内的生物学、物理学、化学、地质学等学科及其分支学科，形式有论文、研究简报、高新技术、高水平综述、学术争鸣等。自 2002 年起，《海洋与湖沼》是中国水科学领域唯一受中国科协择优资助的期刊，同时也是受中国科学院择优资助的刊物。据中国科技信息所资料显示，1996—2006年《海洋与湖沼》的影响因子和总被引频次均居中国水科学领域期刊首位，其中2006年的影响因子为 1.634（他引率为0.9）, 总被引频次为 1772次。《海洋科学集刊》系中国科学院海洋研究所主办，科学出版社出版发行。 1959年由中国科学院院士曾呈奎先生创办，系海洋科学领域综合性刊物，以报道基础理论研究、应用基础研究为主，特别是以生物学的分类学科为重点，并已作为核心期刊被联合国《水科学和渔业文摘》、中国海洋文献数据库、《海洋文摘》、《中国生物学文摘》、中国生物学文献数据库、中国期刊全文数据库（清华光盘版）和中国科技期刊精品数据库收录。 1994年及1995年该刊被中国科学引文数据库列为被引频次最高期刊前500名之一。
