科研方面主要从事植被生产力与生物量遥感、城市扩展遥感动态监测、气候变化与植被覆盖相互关系、地表蒸散发及水热通量等的遥感应用研究。参加的主要科研项目有：国土资源部“城镇土地扩展遥感动态监测”项目（1997-1999年），利用多时相TM遥感影像对河北、浙江两省部分地区土地利用及城市扩展进行了监测；国家自然科学基金课题“中国陆地植被净第一性生产力的全遥感模型研究”（1999-2001年），建立了利用植被指数NDVI估算净第一性生产力（NPP）的模型，并利用NOAA-AVHRR的1公里NDVI数据，实现了全国NPP的估算，对我国NPP的空间分布格局及季节变化进行了研究，并对气候变化情景下我国NPP的可能变化进行了初步分析；“973”项目“黄河流域水资源演化规律与可再生性维持机理”（1999-2004年），利用多时相NOAA-AVHRR NDVI资料对黄河流域近二十年来地表蒸散、植被覆盖的动态变化及其与气候因子之间的关系进行了研究；“973”项目“地球表面时空多变要素的定量遥感理论及应用”（2000-2005年）加拿大CIDA项目“中国碳蓄积量的遥感估算”项目（2002-2005年），主要进行长白山自然保护区、黑河流域上游及下游森林植被净第一性生产力的地面测量及遥感估算研究；863项目“西北半干旱生态植被建设区节水综合技术体系集成与示范”（2002-2005年），选择处于毛乌素沙地腹地的乌审旗作为试验点，进行不同下垫面耗水规律的观测、植被动态变化及沙漠化研究。发表论文：周英, 申双和, 孙睿, 南京地区稻田蒸散的研究, 南京气象学院学报, 1993, 16(4): 492-499孙睿，洪佳华，曹永华，夏玉米光合生产模拟模型初探，中国农业气象，1997，18(2)：20-23洪佳华，孙睿，陶英丽，夏玉米叶片光谱吸收率初探，中国农业气象，1998，19（4）：4-7孙睿，朱启疆，植被净第一性生产力模型及中国净第一性生产力的分析，北京师范大学学报(自然科学版),1998，34(增刊)：132-137孙睿，朱启疆. 陆地植被净第一性生产力的研究. 应用生态学报， 1999，10（6）：757-760刘昌明，孙睿，水环境的生态学方面：土壤－植被－大气系统水分能量平衡研究进展，水科学进展，1999年，10（3）：251-259朱启疆，戎太宗，孙睿，吴门新，林火扩展的分形模拟案例研究，中国科学(E辑)，2000，30(增刊)：106-112Zhu Qijiang, Rong Taizong, Sun Rui, 2000，A case study on fractal simulation of forest fire spread. Science in China(Series E), 43(Supp.),104-112. （SCI收录）孙睿，朱启疆，中国陆地植被净第一性生产力及季节变化研究，地理学报，2000年，55（1）：36-45孙睿，朱启疆. 气候变化对中国陆地植被净第一性生产力影响的初步研究. 遥感学报，2001，5(1) : 58-61Sun Rui, Zhu Qi-jiang. Estimation of net primary productivity in China using remote sensing data. Journal of Geographical Sciences, 2001, vol. 11, No.1,14-23孙睿，刘昌明，朱启疆，黄河流域植被覆盖度动态变化与降水的关系，地理学报，2001，56（6）：667-672Rui Sun，Qijiang Zhu. Estimation of Net Primary Productivity in China Using NOAA AVHRR Data. IEEE 2001 International Geoscience and Remote Sensing Symposium, JUL 09-13, 2001Qijiang Zhu，Taizong Rong，Rui Sun， Yanmin Shuai. A Study on Fractal Simulation of Forest Fire Spread . IEEE 2001 International Geoscience and Remote Sensing Symposium, JUL 09-13, 2001Tang Shihao, Zhu Qijiang, Li Xiaowen, Sun Rui, Yan Guangjian, Inversion of the Li-Strahler GOMS Model for Component Signatures and Fractions. IEEE 2001 International Geoscience and Remote Sensing Symposium, JUL 09-13, 2001Sun Rui, Liu Chang-ming, Zhu Qi-jiang, Dynamic change of net primary productivity and fractional vegetation cover in the Yellow River Basin using multi-temporal AVHRR-NDVI data, Journal of Geographical Sciences, 2002, 12(1):29-34杨胜天，刘昌明，杨志峰，孙睿，周晓东，南水北调西线工程区的自然生态环境评价，地理学报，2002，57（1）：11-18Q.J.ZHU, X.CHEN, R.SUN，A Revised Energy Use Efficiency Model to Estimate NPP in China and its Validation，IEEE 2002 International Geoscience and Remote Sensing Symposium (IGARSS’02) , JUN 24-28, 2002（EI源刊）Zhou YY, Zhu QJ, Sun R, The research of soil moisture difference using the delaying effect of the precipitation on the vegetation. IEEE 2002 International Geoscience and Remote Sensing Symposium/24th Canadian Symposium on Remote Sensing (IGARSS 2002), JUN 24-28, 2002周晓东，朱启疆，王锦地，孙睿，陈雪，吴门新，夏玉米冠层内PAR截获及FPAR与LAI的关系，自然资源学报，2002，17（1）：110-115..周晓东,朱启疆,孙中平,孙睿 ，中国荒漠化气候类型划分方法的初步探讨, 自然灾害学报，2002，11（2）：125-131杨胜天, 刘昌明，孙睿，近20年来黄河流域植被覆盖变化分析，地理学报，2002,57(6):679-684。孙睿，刘昌明，李小文, 利用累积NDVI估算黄河流域年蒸散量, 自然资源学报，2003，18（2）：155-160孙睿, 刘昌明, 地表水热通量研究概述, 应用生态学报，2003，14（3）：434-438杨胜天，刘昌明，孙睿，黄河流域干旱状况的气候与植被特征分析，自然资源学报，2003，18（2）：136-141Sun Rui, Zhou Yuyu, Liu Changming, Yang Shiqi, Response of net primary productivity on climate change in the Yellow Yiver basin, IEEE 2003International Geoscience and Remote Sensing Symposium (IGARSS’03), JUL 21-25, 2003 （EI源刊）Shengtian Yang, Changeming Liu, Sun Rui, The temporal and spatial analysis of drought in Yellow River basin using remote sensing and GIS, IEEE 2003International Geoscience and Remote Sensing Symposium (IGARSS’03), JUL 21-25, 2003（EI源刊）刘绍民，孙睿，孙中平等，基于互补相关原理的区域蒸散量估算模型比较，地理学报，2004，59（3）周涛，史培军，孙睿等，气候变化对中国土壤异养呼吸和净生态系统生产力的影响，地理学报，2004，59（3）Sun. R, Gao X, Liu C-M, Li X-W, Estimation of Evapotranspiration in the Yellow River Basin Using Integrated NDVI Data，Int. J. Remote Sens. 2004, VOL. 25, NO. 13, 2523–2534 (SCI)Rui Sun, J. M. Chen, Qijiang Zhu, et al., Spatial distributions of net primary productivity and evapotranspiration in Changbaishan, China using Landsat ETM data. Canadian Journal of Remote Sensing, 2004 (待刊)
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