参考文献自动编号用word自带的插入尾注功能即可。
如果还要自动按照一定格式生成整条参考文献，就必须用工具软件了，中文期刊一般使用NoteExpress，这个软件大部分学校购买了版权，直接下载正版即可使用。外文期刊一般用EndNote。
书写技巧
把光标放在引用参考文献的地方，在菜单栏上选插入脚注和尾注，弹出的对话框中选择尾注，点击选项，按钮修改编号格式为阿拉伯数字，位置为文档结尾，确定后Word就在光标的地方插入了参考文献的编号，并自动跳到文档尾部相应编号处请你键入参考文献的说明，在这里按参考文献著录表的格式添加相应文献。
1、目录的自动生成。
1.1 在“格式”菜单中选择“样式和格式”，设定文章的主要大纲级别(一般为三级，即有标题1 、标题2、标题3)。
1.2 几级大纲对应几级目录，如果将大纲级别设定为1级，那么就是1级目录。
1.3在要插入目录的地方，点击“插入”-->“引用”-->“索引和目录” 设置目录字体及大小，单击“确定”即可。
2、参考文献的自动生成。
2.1光标移到要插入参考文献的地方，菜单中“插入”——“脚注和尾注”。
2.2对话框中选择“尾注”，编号方式选“自动编号”，所在位置建议选“节的结尾”。
2.3如“自动编号”后不是阿拉伯数字，选右下角的“选项”，在编号格式中选中阿拉伯数字。
2.4确定后在该处就插入了一个上标“1”，而光标自动跳到文章最后，前面就是一个上标“1”，这就是输入第一个参考文献的地方。
2.5将文章最后的上标“1”的格式改成正常(记住是改格式，而不是将它删掉重新输入，否则参考文献以后就是移动的位置，这个序号也不会变)，再在它后面输入所插入的参考文献(格式按杂志要求来慢慢输，好像没有什么办法简化)。
2.6对着参考文献前面的“1”双击，光标就回到了文章内容中插入参考文献的地方，可以继续写文章了。
2.7在下一个要插入参考文献的地方再次按以上方法插入尾注，就会出现一个“2”(Word已经自动为你排序了)，继续输入所要插入的参考文献。
2.8所有文献都引用完后，你会发现在第一篇参考文献前面一条短横线(页面视图里才能看到)，如果参考文献跨页了，在跨页的地方还有一条长横线，这些线无法选中，也无法删除。这是尾注的标志，但一般科技论文格式中都不能有这样的线，所以一定要把它们删除。
2.9切换到普通视图，菜单中“视图”——“脚注”，这时最下方出现了尾注的编辑栏。
2.10在尾注右边的下拉菜单中选择“尾注分隔符”，这时那条短横线出现了，选中它，删除。
2.11再在下拉菜单中选择“尾注延续分隔符”，这是那条长横线出现了，选中它，删除。
2.12切换回到页面视图，参考文献插入已经完成了。这时，无论文章如何改动，参考文献都会自动地排好序了。如果删除了，后面的参考文献也会自动消失，绝不出错。
参考文献自动生成方法
Part 1
1.光标移到要插入参考文献的地方，菜单中“插入”——“引用”——“脚注和尾注”。
2.对话框中选择“尾注”，编号方式选“自动编号”，所在位置选“节的结尾”。
3.如“自动编号”后不是阿拉伯数字，选右下角的“选项”，在编号格式中选中阿拉伯数字。
4.确定后在该处就插入了一个上标“1”，而光标自动跳到文章最后，前面就是一个上标“1”，这就是输入第一个参考文献的地方。
5.将文章最后的上标“1”的格式改成正常(记住是改格式，而不是将它删掉重新输入，否则参考文献以后就是移动的位置，这个序号也不会变)，再在它后面输入所插入的参考文献(格式按杂志要求来慢慢输，好像没有什么办法简化)。
6.对着参考文献前面的“1”双击，光标就回到了文章内容中插入参考文献的地方，可以继续写文章了。
7.在下一个要插入参考文献的地方再次按以上方法插入尾注，就会出现一个“2”(Word已经自动为你排序了)，继续输入所要插入的参考文献。
Part 2
如果同一个参考文献两处被引用，只能在前一个引用的地方插入尾注，不能同时都插入。这样改动文章后，后插入的参考文献的编号不会自动改动。 解决这个问题其实也不难：
1,单击要插入对注释的引用的位置3。
2,单击“插入”菜单中的“引用”——“交叉引用”命令。
3,在“引用类型”框中，单击“脚注”或“尾注”。 (加粗者为首选)
4,在“引用哪一个脚注”或“引用哪一个尾注”框中，单击要引用的`注释。
5,单击“引用内容”框中的“脚注编号”或“尾注编号”选项。
6,单击“插入”按钮，然后单击“关闭”按钮。
不过得注意：Word 插入的新编号实际上是对原引用标记的交叉引用。如果添加、删除或移动了注释，Word 将在打印文档或选定交叉引用编号后按 F9 键时更新交叉引用编号。如果不容易只选定交叉引用编号，请连同周围的文字一起选定，然后按 F9 键。
Part 3
8.所有文献都引用完后，你会发现在第一篇参考文献前面一条短横线(普通视图里才能看到)，如果参考文献跨页了，在跨页的地方还有一条长横线，这些线无法选中，也无法删除。这是尾注的标志，但一般科技论文格式中都不能有这样的线，所以一定要把它们删除。(怎么做?)
9.切换到普通视图，菜单中“视图”——“脚注”——尾注的编辑栏：
10.在尾注右边的下拉菜单中选择“尾注分隔符”，这时那条短横线出现了，选中它，删除。
11.再在下拉菜单中选择“尾注延续分隔符”，这是那条长横线出现了，选中它，删除。
12.切换回到页面视图，参考文献插入已经完成了。这时，无论文章如何改动，参考文献都会自动地排好序了。如果删除了，后面的参考文献也会自动消失，绝不出错。
Part 4
标号上的方括号如何加呢?很简单：在全文中，查找——高级——特殊字符——尾注标记(它会自动显示^e)——替换为[^&]即可;如果用了脚注就查找脚注标记^f,再全部替换为[^&]便可以了(注意查找时让“不限定格式”按钮为灰色)
参考文献引用怎么自动生成
参考文献引用怎么自动生成,在写毕业论文的时候，参考文献的处理是一件非常难的事情，而且已经排好的参考文献顺序还会发生变化，下面我带大家简单了解一下参考文献引用怎么自动生成。
一、问题提出
你是否有这样的烦恼：
（1）几十条，甚至上百条的论文参考文献顺序变动了，需要手动输入和更新论文中每条引用的编号？
（2）硬着头皮，逐条手动修改后，发现很多地方的引用编号与参考文献条目顺序号不一致。
这样子折腾下来，费时费力。
于是，问题就来了，大神们平时是怎么样解决这个问题的？
二、如何解决
主要步骤有三：创建文献编号>>插入交叉引用>>自动更新域。
步骤一：定义参考文献的编号格式。
1、将每一条参考文献按段落格式排版，并选中之。
2、打开选项卡：“开始>>有序编号>>定义新编号格式（D）”。
3、在编号格式中，输入“[”和“]”，然后，在中间插入编号“1，2，3…”，对齐方式为左对齐，预览无误后确定。
添加编号后的效果如下图所示：
步骤二：插入交叉引用，并插入论文对应位置。
1、路径：在Word选项卡上，“插入>>交叉引用”。
2、目的：引用文档中设定的参考文献编号项。
3、方法：
〔1〕引用类型>>编号项，引用内容>>段落编号；
〔2〕选择需引用的编号项，并插入到论文对应位置。
步骤三：自动更新域，使得对应的文献编号同步变化。
当参考文献列表顺序发生变化时：
1、在论文中，选中引用的“编号项”，如编号项[4]；
2、选中后，右键>>更新域（U），则对应的编号项将跟随参考文献列表变化。
是不是很简单？
试试吧！从此以后，你再也不用为参考文献条目发生变化而需要更新引用项而烦恼了。
打开需要排版的论文；
我们使用一篇参考文献尚未编号的论文为例，从头讲解引用的`自动生成过程。
我们首先对参考文献进行编号，编号的详细过程如图中所示；
然后，我们将光标放到需要插入参考文献引用的位置，在Word的“插入”模块中选择“交叉引用”；
在弹出的对话框中，选择要引用的文献；
备注：这里的“插入超链接”选项可以勾掉。
点击“插入”按钮，就可以该位置已经正确的插入了引用；
当我们的参考文献编号发生变化时，比如之前第一篇参考文献变成了第三篇，我们只需要选择文中之前插入的引用，点击右键，选择更新域，引用就会自动更新啦！
参考文献自动生成小技巧
参考文献格式难弄?一修改论文参考文献的序号就全乱了，怎么办?下面是我为您搜集整理的参考文献自动生成小技巧，希望能对您有所帮助。
1.以尾注的方式插入第一个参考文献。
将光标定位于word文档中将要插入参考文献的位置，按“插入/引用/脚注和尾注”。出现一菜单，选择“尾注”，“文档结尾”，编号格式为“1,2,3”。按“插入”按钮。
2.按要求的格式输入参考文献内容。
这时你会发现文本中的序号“1”字是上标格式的，这是你所希望的。但尾注中的“1”也是上标格式的，这不是你希望的。其余的格式也不合你愿，别急。用鼠标在最左侧处选中尾注中的序号“1”，按快捷键“ctrl+shift+=”就可以使序号不再是上标，或用鼠标右击，出现一菜单，选择“字体”，在第二张菜单中去掉“效果”栏中“上标”前面的“√”。
3.说明：
序号周围有似隐似现的框，这表示所插入手稿的尾注是一种“域”，不必理会它。
插入第二个尾注的方法是同样的。Word会根据所在位置的前后自动排序。
在第一个参考文献的前面有一条横线，你会发现无法删除。它叫“尾注分隔符”。
4.去除“尾注分隔符”
我们一般的'编辑界面叫“页面视图”，选择“视图/普通”进入普通视图。
按“视图/脚注”，此时编辑界面分为两个部分，下面的编辑框是尾注编辑框。
选择尾注编辑框中的“尾注”下拉框，选择“尾注分隔符”，出现一条横线，选择该横线，删除它，再选择“尾注延续分隔符”，也会出现一条横线(这是尾注分页时会出现的很长的横线)，选择该横线，删除它。关闭后，再按“视图/页面”切换回来。
5.交叉引用
当你在文档中第N(N>=2)次引用前面文档曾经引用过的文献时，这时宜采用“交叉引用”。方法：按“插入/引用/交叉引用”，出现一菜单，在引用类型中选择“尾注”，引用内容为“尾注编号”，这时在菜单中会出现你曾经编写过的所有尾注，选择你需要的，按“插入”按钮即完成交叉引用了。
(注：若你后来又在前面的文档中插入新的尾注，这时后继的尾注会自动更新编号，但交叉引用不会自动更新。怎么办?按“ctrl+A”选择所有内容后，按“F9”键就可以完成手动更新。)
附带介绍一下如何自动生成目录?
1、首先保证你的论文各级标题都正确使用了样式格式(如“前言”为一级标题，选中后在“样式”窗口内选择“标题1”，“方法”为二级标题，选择“标题2”)。
2、使用“插入”菜单中的“引用”之“索引和目录”，选择“目录”，取消“使用链接而不使用页码”，选中“显示页码”和“页码右对齐”，选择合适的“制表符前导符”，选择预显示的目录级别，在“修改”中选择目录中的字体和字号，确定后即可生成目录。
3、每次变更内容引起页码变化，可以直接在目录上点右键，选更新域，选“更新页码”。若标题有变化，选“更新内容”。
4、如果生成的目录有很多非标题的内容，可以选择这些内容，在“样式”窗口内选择“清除格式”。
5、生成目录前，使用“视图”中的“文档结构图”，在文档的左侧会显示你的文档的大纲结构，所有带格式的标题应该完整地显示，而且与目录的三级标题一致。只有文档结构图完全理想无误，才可以生成目录。文档结构图还可以用来迅速定位编辑部位，使用十分方便。
