论文目录格式错误抽检能合格吗

第一，格式不对会有影响的，尤其是引用部分格式如果不对，对结果的影响很大
第二，你自己查重和学校查重的结果相差这么多，是不是你用的查重系统和学校的不一样呢？不同系统查重，对结果也有影响
第三，自己查重后提交给学校查重中间的时间如果间隔过长，结果也有有差异，数据库随时在更新的，如果时间间隔长，可能之前查重通过的在数据库更新重复率就上去了
以上三点都可能有影响，如果都排除了，那可能就是你文章方面的问题，自己要加油降重了

论文目录格式的会对重复率有影响吗？

对于知网的查重系统，是有影响的。
知网查重系统不查重目录，如果您目录格式不对，就会被检测，目录格式不对，重复率可能会比正确的目录格式要高。
如果是paperpass或者维普系统，结果是一样的。
知网查重；维普查重

上交研究生论文发生格式错误影响通过吗？

格式错误不会影响机器检测的通过，但是会影响到后面的专家匿名评阅分数，由此影响论文的最后通过。格式正确与否，是一份论文的基础。