首先要告诉大家的是无论是word还是pdf格式，这两种格式都是可以识别的.并且除了这两种格式之外，中国知网还支持其他论文格式.中国知网论文查重系统支持doc，docx，wps，caj，txt，pdf，kdh，nh，rtf多种格式上传，每一种格式上传，用相应正版软件读取内容并进行解析.所以只要是上面的格式，论文作者就都可以不用太过担心.但是，检测结果是否存在差异，要取决于读取内容是否一致决定.因为在实践中发现，同一篇文章用不同的写作工具编辑，其内容会出现个别差异.所以pdf和word格式之间的检测结果还是有区别的.
第一点PDF格式由于私密性强，很难被转换格式，或者被编辑，因此PDF文档提交到知网查重系统内以后，知网查重系统需要对PDF里的内容进行扫描，解析，这个解析过程可能会出现解析不成功，解析出乱码的情况，如果是乱码，那么知网查重结果就完全跟正常情况的结果不同了.
第二点:如果论文里面有大量的脚注、尾注，或者页眉页脚内有大量的内容，正常word文档内知网查重系统是可以区别这些脚注尾注，页眉页脚的，这些内容是不跟正文一起参与到查重的.在PDF格式下，上述部分很大几率被识别为正文，一起参与到查重中，这样查重结果就会有区别.
第三点:中国知网查重时，Word中的图片和公式根本都是检测不到的，而在PDF格局中图片和公式会通过处理辨认成文本而进行检测，这样辨认出来的内容和图片以及公式有很大差别而被检测成抄袭，PDF是不合理的.
第四点:同一篇论文，在word和PDF里面，可能会造成论文章节和结构有细微的差别，这些细微差别可能会导致知网查重时，段落划分出现不同，目录识别也可能会造成段落划分不同，这些都会影响到论文内容的标红，进而影响知网查重结果.
硕士论文机检尽量使用word格式。
因为就检测结果来说，通常是PDF结果要偏高一下，而word检测结果是最为准确接近真实情况的。
PDF格式由于私密性强，很难被转换格式，或者被编辑。如果论文里面有大量的脚注、尾注、或者页眉页脚内有大量的内容，在PDF格式下，上述部分很大几率被识别为正文，一起参与到查重中，这样查重结果就会有区别。
同一篇论文，在word和PDF里面，可能会造成论文章节和结构有细微的差别，这些细微差别可能会导致知网查重时，段落划分出现不同。这些都会影响到论文内容的标红，进而影响知网查重结果。专业老师在线权威答疑 zy.offercoming.com
1、格式技术的不同，PDF主要技术由派生自PostScript页面描述语言的子集，字体嵌入/替换系统，结构化的存储系统三大类组成。
而Word并没有统一规范化，其文件格式的详细数据并不对外公开；
2、阅读观感上的不同，PDF支持无级放大（矢量格式），而且PDF格式图形不可编辑，大部分的PDF浏览器都不能编辑；由于Word在不同版本中有格式兼容的问题，可能会导致编辑好的版式出现不同，因此在观感上不如PDF；
3、编辑性，PDF只能通过Adobe公司提供的acrobat等少数软件实现编辑功能，不如Word方便，Word在可编辑程度上要远远高于PDF。
