不算，若用户引用参考文献的格式设置正确，查重系统不会计算参考文献的重复率，而是计算参考文献的引用率是多少。查重系统在对参考文献查重时，会先识别参考文献的引用格式，若格式正确，查重系统会将参考文献的内容和引用库的内容进行比对，如果内容一致，查重系统就会判断这部分内容为参考文献部分。
在写论文过程中引证文献是在正常不过的事情了，在写作之前要阅览很多的文献，了解行业界学科发展的状况，这本身也是常识积累和学习的一个过程，因此，只要作者在写论文的时候，用正确的引用格式，且引用的部分不是很大就不会有影响，知网论文查重会自动识别为引用部分，以绿色字体标注。但是一定要注意的是，引用过程中绝对不能大片的引用，因为也会被检测为抄袭。
在论文查重过程中，引用文献的部分是要计算重复率的。
知网查重是以句子为单位的。即将文章以句子为单位进行分割，然后与知网数据库中的论文逐句对比，若其中有主要内容相同，即实词，如名词、动词、专业词汇等，则标红。若一个段落中出现大量标红的句子，则计算在论文重复率中。
知网查重规则
一般来说，知网查重总重复率=重复字数/总字数*100%。再以结果对比标准，如果在标准之内，论文通过检测，否则，论文需要修改或重写。另外，知网论文检测中有自己的计算规则，一段文字里面，如果连续13个字出现重复，那么这段文字将会判定成重复内容。
