《汉代学术史略》，人民出版社，2008
《中国疆域沿革史》，商务印书馆，1999
《中国影戏略史及其现状》
《崔东壁遗书·序言》，亚东图书馆，1936
《古籍考辨丛刊》（第一集），中华书局，1955
《史林杂识》（初编），中华书局，1963
《秦汉的方士与儒生》，上海古籍出版社，1978
《尚书通检》，上海古籍出版社，1990
《中国历史地图集（古代史部分）》，（与章巽共同编写，谭其骧校订）
《中国上古史研究讲义》，中华书局，1988
《顾颉刚古史论文集》（第一至第三集），中华书局，1988
在学术史上顾颉刚这个名字一直是与古史辨派联系在一起的。作为古史辨派的领军人物，他主张用历史演进的观念和大胆疑古的精神，吸收西方近代社会学、考古学等方法，研究中国古代的历史和典籍。自1923年顾颉刚发表《与钱玄同论古史书》到1926年《古史辨》第一册问世，标志着该派的正式形成。
以后，《古史辨》又持续出到七册，当时有不少知名学者参与了这项学术事业，在学术界形成了很大的影响。古史辨派在其研究中，推翻了传统所谓的“盘古开天地”、“三皇五帝”等概念构成的中国古史系统。
其中，顾颉刚提出了著名的“层累地造成的中国古史”的观点。他着重地考察了中国古代思想文化的源头，认为：“时代愈后，传说中的古史期愈长”；“时代愈后，传说中的中心人物愈放愈大”；虽然“不能知道某一件事的真确的状况，但可以知道某一件事在传说中的最早的状况”。
据此，他提出要打破“民族出于一统”、“地域向来一统”、“古史为黄金世界”等根深蒂固的传统观念，他将史学上的创见运用到民间文学、民俗学领域来，取得了极大成就。
史学研究顾颉刚作为一个史学家，享誉中外学术界，影响深远。顾颉刚的私淑弟子黄现璠曾说：“解放前，日本学者，特别是名牌大学如东京、京都、帝大教授，都看不起中国学者，惟对于顾颉刚先生和陈垣先生，则推崇备至。” 他将史学上的创见运用到民间文学、民俗学领域来，为之贯注新血液，探讨新方法，同样取得了极大成就。他在孟姜女故事和歌谣学、民俗学诸方面的研究，赢得了很高的荣誉。1924年，顾颉刚在《歌谣》周刊上连载《吴歌甲集》，历时三月，获得学术界好评。《吴歌甲集》于1926年由北大歌谣研究会出版单行本，这是一部科研价值很高的歌谣集子，不但出版的时间较早，而且有比较详尽的注释等，还附有研究文章《写歌杂记》多篇。刘半农写信给他说：“中国民俗学的第一把交椅，给你抢去坐稳了。”民俗研究在民俗方面，顾颉刚作过很多考察研究。对妙峰山的考察，对土地神的探究以及对苏州婚丧礼节的论述,都不断有文章发表。在风气未开的当时，影响颇大。其中《妙峰山的香会》对群众朝拜碧霞元君女神的盛况作了考察研究，分析各种人朝拜、祈福的迷信心理和庙主假神戚敛财的实质，发现了人民物质生活水平和祈福心理的关系。这体现了顾颉刚不是为调查而调查，为研究而研究的学术观点。吴歌研究1918年，他因病休学在家，因《北大日刊》的影响，开始搜集“怡情适性”的歌谣。他的搜集工作只有八个月，连带搜集了谚语、方言方音，后来发表于《晨报》，得到“研究歌谣专家”称号。他的研究成果首先得到来自文学方面的称赞。胡适说:《吴歌甲集》“是独立的吴语文学的第一部”、“道地的方言文学”、“这部书的出世真可说是给中国文学又开一新纪元了。”他此书突出的成绩在于对歌谣结合吴地的地域文化（特别是民俗）进行阐释；标明歌谣适合的场所、参与者、具体的动作等；不同地域歌谣的变化；特别是它内容详实的附录———阐述了从题目的类型到《诗经》以来的争论。在这种意义上来说《吴歌甲集》“不只是一个一般性的歌谣资料集，而是具有较高的科学价值的歌谣学著述了。像这样比较完善的民间文学整理本，不要说在解放前，就是在解放后也是不多见的”。故事研究顾颉刚的孟姜女故事研究，在中国是首次对传说故事进行精细和系统的考证。他对记载于各种古籍和流传于当时口头的有关材料进行分析，对这个故事的产生、传播及变异状况进行系统的考证，意在对孟姜女故事起源的时间、地点和情节变化以及与历史的关系，作出尽可能科学的阐释。其《孟姜女的故事转变》和《孟姜女故事研究》是这方面的代表作，从纵横两方面提出了故事的历史系统和地理系统。特别是后文，更加全面而系统地体现了顾颉刚的见解，他最重视“演变法则”，试图由此来认识故事的源头、发展及变形。显然，他是将其古史学说“层累地造成的古史”的观点运用到这个故事的研究中来的，这使其在这个研究领域里的成就卓然不群。顾颉刚对孟姜女故事研究的结论，一直很有影响，特别是其中对故事历史系统的研究成果，多年来一直成为定论。后来的许多民间文艺研究者，多在上面作些补充与发挥，他的“演变法则”，也成为至今还在沿用的研究方法。当然，顾颉刚的孟姜女故事研究，主要目的是“为研究古史方法举一旁证的例”，是将传说作为研究历史的资料。研究结果表明，从孟姜女故事已看不清杞梁妻的真正历史面目了。既然如此，传说中记载的其他古史现象也便不可信了。这才是顾颉刚研究孟姜女故事的真正目的，文章中贯穿了新疑古派的思想与方法。在古史研究中，顾颉刚还涉及到许多古神话传说故事，对尧、舜、禹等神话传说均有研究。顾颉刚为中国民间文艺理论建设作出了很大贡献。他那种对民间文艺作出了很大贡献。他那种对民间文艺作动态考察的眼光（“演变法则”）和对古籍资料搜求鉴别的真知灼见，曾给我国民间文艺研究以巨大影响，他研究中被及到一些神话传说人物、事件等，成为后来一些人的研究课题。除此，单就他在主编杂志、主持学会、宣传民间文艺、提醒带动同人进行民间文艺研究方面作的辛勤努力和所起的倡导性作用而言，其功劳也是异常卓著的。 《古史辨》（第一至第七册），上海古籍出版社，1982 （重印本） 《汉代学术史略》，人民出版社，2008 《中国疆域沿革史》，商务印书馆，1999 《中国影戏略史及其现状》 《崔东壁遗书·序言》，亚东图书馆，1936 《古籍考辨丛刊》（第一集），中华书局，1955 《史林杂识》（初编），中华书局，1963 《秦汉的方士与儒生》，上海古籍出版社，1978 《尚书通检》，上海古籍出版社，1990 《中国历史地图集（古代史部分）》，（与章巽共同编写，谭其骧校订） 《中国上古史研究讲义》，中华书局，1988 《顾颉刚古史论文集》（第一至第三集），中华书局，1988 《顾颉刚读书笔记》，台湾联经出版事业公司，1990 《汉代学术史略》，东方出版社，1996 《中国现代学术经典·顾颉刚卷》，河北教育出版社，1996 《浪口村随笔》，辽宁教育出版社，1998 《中国当代史学》，辽宁教育出版社，1998 《中国疆域沿革史》，商务印书馆，1999 《我与〈古史辨〉》，上海文艺出版社，2001 《西北考查日记》，甘肃人民出版社，2002 《〈尚书〉校释译论》，中华书局，2005 《顾颉刚全集》，中华书局，2010 《国史讲话》，中华书局，2010 《顾颉刚日记》，中华书局，2011 《国史讲话全本》，上海人民出版社，2015
